Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Impg1Q8R1W8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Impg1Q8R1W8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Impg1Q8R1W8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Impg1Q8R1W8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Impg1Q8R1W8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Impg1Q8R1W8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Impg1Q8R1W8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Impg1Q8R1W8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Impg1Q8R1W8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Impg1Q8R1W8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Impg1Q8R1W8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Impg1Q8R1W8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Impg1Q8R1W8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Impg1Q8R1W8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Impg1Q8R1W8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Impg1Q8R1W8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Impg1Q8R1W8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Impg1Q8R1W8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Impg1Q8R1W8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Impg1Q8R1W8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Impg1Q8R1W8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Impg1Q8R1W8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Impg1Q8R1W8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Impg1Q8R1W8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Impg1Q8R1W8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Impg1Q8R1W8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Impg1Q8R1W8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Impg1Q8R1W8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Impg1Q8R1W8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Impg1Q8R1W8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Impg1Q8R1W8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Impg1Q8R1W8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Impg1Q8R1W8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Impg1Q8R1W8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Impg1Q8R1W8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Impg1Q8R1W8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Impg1Q8R1W8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Impg1Q8R1W8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Impg1Q8R1W8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Impg1Q8R1W8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Impg1Q8R1W8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Impg1Q8R1W8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Impg1Q8R1W8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Impg1Q8R1W8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Impg1Q8R1W8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Impg1Q8R1W8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Impg1Q8R1W8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Impg1Q8R1W8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Impg1Q8R1W8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Impg1Q8R1W8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Impg1Q8R1W8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Impg1Q8R1W8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Impg1Q8R1W8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Impg1Q8R1W8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Impg1Q8R1W8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Impg1Q8R1W8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Impg1Q8R1W8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Impg1Q8R1W8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Impg1Q8R1W8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Impg1Q8R1W8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Impg1Q8R1W8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Impg1Q8R1W8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Impg1Q8R1W8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Impg1Q8R1W8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Impg1Q8R1W8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Impg1Q8R1W8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Impg1Q8R1W8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Impg1Q8R1W8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Impg1Q8R1W8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Impg1Q8R1W8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Impg1Q8R1W8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Impg1Q8R1W8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Impg1Q8R1W8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Impg1Q8R1W8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Impg1Q8R1W8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Impg1Q8R1W8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
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