Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gga1Q8R0H9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gga1Q8R0H9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gga1Q8R0H9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gga1Q8R0H9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gga1Q8R0H9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gga1Q8R0H9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gga1Q8R0H9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gga1Q8R0H9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gga1Q8R0H9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gga1Q8R0H9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gga1Q8R0H9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Gga1Q8R0H9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gga1Q8R0H9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gga1Q8R0H9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gga1Q8R0H9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gga1Q8R0H9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gga1Q8R0H9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gga1Q8R0H9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gga1Q8R0H9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gga1Q8R0H9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gga1Q8R0H9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gga1Q8R0H9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gga1Q8R0H9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gga1Q8R0H9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gga1Q8R0H9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gga1Q8R0H9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gga1Q8R0H9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gga1Q8R0H9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gga1Q8R0H9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gga1Q8R0H9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gga1Q8R0H9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gga1Q8R0H9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gga1Q8R0H9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gga1Q8R0H9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gga1Q8R0H9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gga1Q8R0H9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gga1Q8R0H9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gga1Q8R0H9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gga1Q8R0H9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gga1Q8R0H9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gga1Q8R0H9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gga1Q8R0H9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Gga1Q8R0H9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gga1Q8R0H9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gga1Q8R0H9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gga1Q8R0H9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gga1Q8R0H9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gga1Q8R0H9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gga1Q8R0H9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gga1Q8R0H9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gga1Q8R0H9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gga1Q8R0H9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gga1Q8R0H9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gga1Q8R0H9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gga1Q8R0H9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gga1Q8R0H9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gga1Q8R0H9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gga1Q8R0H9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gga1Q8R0H9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Gga1Q8R0H9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gga1Q8R0H9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gga1Q8R0H9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gga1Q8R0H9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gga1Q8R0H9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gga1Q8R0H9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gga1Q8R0H9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gga1Q8R0H9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gga1Q8R0H9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gga1Q8R0H9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gga1Q8R0H9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gga1Q8R0H9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gga1Q8R0H9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Gga1Q8R0H9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gga1Q8R0H9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gga1Q8R0H9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gga1Q8R0H9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gga1Q8R0H9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gga1Q8R0H9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gga1Q8R0H9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gga1Q8R0H9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gga1Q8R0H9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gga1Q8R0H9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gga1Q8R0H9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gga1Q8R0H9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gga1Q8R0H9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gga1Q8R0H9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gga1Q8R0H9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gga1Q8R0H9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Gga1Q8R0H9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gga1Q8R0H9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gga1Q8R0H9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gga1Q8R0H9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gga1Q8R0H9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Gga1Q8R0H9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gga1Q8R0H9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gga1Q8R0H9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Gga1Q8R0H9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gga1Q8R0H9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gga1Q8R0H9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms