Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b4Q8QZY9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b4Q8QZY9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b4Q8QZY9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b4Q8QZY9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b4Q8QZY9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b4Q8QZY9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b4Q8QZY9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b4Q8QZY9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b4Q8QZY9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b4Q8QZY9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b4Q8QZY9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b4Q8QZY9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b4Q8QZY9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b4Q8QZY9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b4Q8QZY9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b4Q8QZY9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b4Q8QZY9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b4Q8QZY9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b4Q8QZY9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b4Q8QZY9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sf3b4Q8QZY9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b4Q8QZY9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b4Q8QZY9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b4Q8QZY9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b4Q8QZY9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b4Q8QZY9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b4Q8QZY9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b4Q8QZY9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b4Q8QZY9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b4Q8QZY9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b4Q8QZY9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b4Q8QZY9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b4Q8QZY9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Sf3b4Q8QZY9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b4Q8QZY9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b4Q8QZY9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b4Q8QZY9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3b4Q8QZY9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b4Q8QZY9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b4Q8QZY9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b4Q8QZY9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b4Q8QZY9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b4Q8QZY9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b4Q8QZY9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b4Q8QZY9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b4Q8QZY9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b4Q8QZY9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b4Q8QZY9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b4Q8QZY9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Sf3b4Q8QZY9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b4Q8QZY9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b4Q8QZY9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b4Q8QZY9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b4Q8QZY9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b4Q8QZY9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b4Q8QZY9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b4Q8QZY9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b4Q8QZY9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b4Q8QZY9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b4Q8QZY9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b4Q8QZY9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b4Q8QZY9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b4Q8QZY9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b4Q8QZY9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b4Q8QZY9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b4Q8QZY9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b4Q8QZY9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b4Q8QZY9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b4Q8QZY9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b4Q8QZY9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b4Q8QZY9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b4Q8QZY9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b4Q8QZY9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b4Q8QZY9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b4Q8QZY9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b4Q8QZY9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Sf3b4Q8QZY9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b4Q8QZY9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b4Q8QZY9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b4Q8QZY9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b4Q8QZY9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b4Q8QZY9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b4Q8QZY9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b4Q8QZY9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b4Q8QZY9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b4Q8QZY9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b4Q8QZY9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b4Q8QZY9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b4Q8QZY9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b4Q8QZY9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b4Q8QZY9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms