Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpv3Q8K424 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpv3Q8K424 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpv3Q8K424 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpv3Q8K424 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpv3Q8K424 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpv3Q8K424 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpv3Q8K424 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpv3Q8K424 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpv3Q8K424 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpv3Q8K424 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpv3Q8K424 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpv3Q8K424 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpv3Q8K424 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpv3Q8K424 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trpv3Q8K424 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trpv3Q8K424 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpv3Q8K424 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trpv3Q8K424 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpv3Q8K424 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpv3Q8K424 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpv3Q8K424 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpv3Q8K424 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpv3Q8K424 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpv3Q8K424 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpv3Q8K424 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpv3Q8K424 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpv3Q8K424 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpv3Q8K424 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpv3Q8K424 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpv3Q8K424 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpv3Q8K424 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpv3Q8K424 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpv3Q8K424 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpv3Q8K424 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpv3Q8K424 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpv3Q8K424 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpv3Q8K424 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpv3Q8K424 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpv3Q8K424 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpv3Q8K424 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpv3Q8K424 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpv3Q8K424 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpv3Q8K424 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpv3Q8K424 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpv3Q8K424 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv3Q8K424 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv3Q8K424 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv3Q8K424 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv3Q8K424 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpv3Q8K424 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpv3Q8K424 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpv3Q8K424 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpv3Q8K424 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpv3Q8K424 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv3Q8K424 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpv3Q8K424 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpv3Q8K424 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpv3Q8K424 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpv3Q8K424 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpv3Q8K424 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpv3Q8K424 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpv3Q8K424 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpv3Q8K424 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpv3Q8K424 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpv3Q8K424 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpv3Q8K424 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpv3Q8K424 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpv3Q8K424 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpv3Q8K424 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpv3Q8K424 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpv3Q8K424 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpv3Q8K424 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpv3Q8K424 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpv3Q8K424 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpv3Q8K424 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpv3Q8K424 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms