Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X8

Gtf2h5, General transcription factor IIH subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2h5Q8K2X8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2h5Q8K2X8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2h5Q8K2X8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2h5Q8K2X8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2h5Q8K2X8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2h5Q8K2X8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2h5Q8K2X8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2h5Q8K2X8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2h5Q8K2X8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2h5Q8K2X8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2h5Q8K2X8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2h5Q8K2X8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2h5Q8K2X8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2h5Q8K2X8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2h5Q8K2X8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2h5Q8K2X8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2h5Q8K2X8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2h5Q8K2X8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gtf2h5Q8K2X8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2h5Q8K2X8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2h5Q8K2X8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2h5Q8K2X8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2h5Q8K2X8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2h5Q8K2X8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2h5Q8K2X8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2h5Q8K2X8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2h5Q8K2X8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2h5Q8K2X8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2h5Q8K2X8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2h5Q8K2X8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2h5Q8K2X8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2h5Q8K2X8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2h5Q8K2X8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2h5Q8K2X8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2h5Q8K2X8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2h5Q8K2X8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2h5Q8K2X8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2h5Q8K2X8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2h5Q8K2X8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2h5Q8K2X8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2h5Q8K2X8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2h5Q8K2X8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2h5Q8K2X8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gtf2h5Q8K2X8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2h5Q8K2X8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms