Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2P6

Rfesd, Rieske domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfesdQ8K2P6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RfesdQ8K2P6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RfesdQ8K2P6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RfesdQ8K2P6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RfesdQ8K2P6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RfesdQ8K2P6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RfesdQ8K2P6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RfesdQ8K2P6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RfesdQ8K2P6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RfesdQ8K2P6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RfesdQ8K2P6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RfesdQ8K2P6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RfesdQ8K2P6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RfesdQ8K2P6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RfesdQ8K2P6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RfesdQ8K2P6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RfesdQ8K2P6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RfesdQ8K2P6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RfesdQ8K2P6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RfesdQ8K2P6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RfesdQ8K2P6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RfesdQ8K2P6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RfesdQ8K2P6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RfesdQ8K2P6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RfesdQ8K2P6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RfesdQ8K2P6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RfesdQ8K2P6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RfesdQ8K2P6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RfesdQ8K2P6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RfesdQ8K2P6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RfesdQ8K2P6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RfesdQ8K2P6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RfesdQ8K2P6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RfesdQ8K2P6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RfesdQ8K2P6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RfesdQ8K2P6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RfesdQ8K2P6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RfesdQ8K2P6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RfesdQ8K2P6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RfesdQ8K2P6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RfesdQ8K2P6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RfesdQ8K2P6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RfesdQ8K2P6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RfesdQ8K2P6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RfesdQ8K2P6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RfesdQ8K2P6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RfesdQ8K2P6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RfesdQ8K2P6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RfesdQ8K2P6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RfesdQ8K2P6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RfesdQ8K2P6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RfesdQ8K2P6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RfesdQ8K2P6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RfesdQ8K2P6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RfesdQ8K2P6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RfesdQ8K2P6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RfesdQ8K2P6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RfesdQ8K2P6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RfesdQ8K2P6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RfesdQ8K2P6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RfesdQ8K2P6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RfesdQ8K2P6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RfesdQ8K2P6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RfesdQ8K2P6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RfesdQ8K2P6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RfesdQ8K2P6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RfesdQ8K2P6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RfesdQ8K2P6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RfesdQ8K2P6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RfesdQ8K2P6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RfesdQ8K2P6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RfesdQ8K2P6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RfesdQ8K2P6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RfesdQ8K2P6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RfesdQ8K2P6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RfesdQ8K2P6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RfesdQ8K2P6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RfesdQ8K2P6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RfesdQ8K2P6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RfesdQ8K2P6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RfesdQ8K2P6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RfesdQ8K2P6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RfesdQ8K2P6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RfesdQ8K2P6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RfesdQ8K2P6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RfesdQ8K2P6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RfesdQ8K2P6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RfesdQ8K2P6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RfesdQ8K2P6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RfesdQ8K2P6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RfesdQ8K2P6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RfesdQ8K2P6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RfesdQ8K2P6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RfesdQ8K2P6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RfesdQ8K2P6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RfesdQ8K2P6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RfesdQ8K2P6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RfesdQ8K2P6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RfesdQ8K2P6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RfesdQ8K2P6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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