Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c1Q8K284 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c1Q8K284 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gtf3c1Q8K284 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c1Q8K284 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c1Q8K284 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c1Q8K284 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c1Q8K284 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c1Q8K284 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtf3c1Q8K284 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c1Q8K284 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c1Q8K284 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c1Q8K284 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c1Q8K284 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c1Q8K284 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c1Q8K284 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c1Q8K284 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c1Q8K284 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf3c1Q8K284 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf3c1Q8K284 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf3c1Q8K284 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf3c1Q8K284 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c1Q8K284 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf3c1Q8K284 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf3c1Q8K284 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf3c1Q8K284 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c1Q8K284 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c1Q8K284 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c1Q8K284 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf3c1Q8K284 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c1Q8K284 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c1Q8K284 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c1Q8K284 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c1Q8K284 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c1Q8K284 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c1Q8K284 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c1Q8K284 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c1Q8K284 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c1Q8K284 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c1Q8K284 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf3c1Q8K284 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf3c1Q8K284 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf3c1Q8K284 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c1Q8K284 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf3c1Q8K284 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf3c1Q8K284 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf3c1Q8K284 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf3c1Q8K284 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf3c1Q8K284 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf3c1Q8K284 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf3c1Q8K284 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf3c1Q8K284 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtf3c1Q8K284 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtf3c1Q8K284 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf3c1Q8K284 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf3c1Q8K284 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf3c1Q8K284 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf3c1Q8K284 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf3c1Q8K284 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf3c1Q8K284 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf3c1Q8K284 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf3c1Q8K284 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf3c1Q8K284 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf3c1Q8K284 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf3c1Q8K284 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf3c1Q8K284 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf3c1Q8K284 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf3c1Q8K284 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c1Q8K284 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c1Q8K284 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c1Q8K284 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf3c1Q8K284 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf3c1Q8K284 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf3c1Q8K284 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c1Q8K284 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c1Q8K284 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c1Q8K284 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms