Protein–RNA interactions for Protein: Q8K259

Gin1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gin1Q8K259 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gin1Q8K259 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gin1Q8K259 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gin1Q8K259 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gin1Q8K259 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gin1Q8K259 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gin1Q8K259 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gin1Q8K259 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gin1Q8K259 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gin1Q8K259 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gin1Q8K259 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gin1Q8K259 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gin1Q8K259 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gin1Q8K259 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gin1Q8K259 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gin1Q8K259 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gin1Q8K259 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gin1Q8K259 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gin1Q8K259 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gin1Q8K259 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gin1Q8K259 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gin1Q8K259 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gin1Q8K259 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gin1Q8K259 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gin1Q8K259 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gin1Q8K259 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gin1Q8K259 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gin1Q8K259 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gin1Q8K259 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gin1Q8K259 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gin1Q8K259 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gin1Q8K259 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gin1Q8K259 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gin1Q8K259 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gin1Q8K259 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gin1Q8K259 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gin1Q8K259 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gin1Q8K259 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gin1Q8K259 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gin1Q8K259 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gin1Q8K259 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gin1Q8K259 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gin1Q8K259 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gin1Q8K259 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gin1Q8K259 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gin1Q8K259 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gin1Q8K259 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gin1Q8K259 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gin1Q8K259 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gin1Q8K259 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gin1Q8K259 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gin1Q8K259 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gin1Q8K259 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gin1Q8K259 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gin1Q8K259 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gin1Q8K259 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gin1Q8K259 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gin1Q8K259 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gin1Q8K259 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gin1Q8K259 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gin1Q8K259 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gin1Q8K259 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gin1Q8K259 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gin1Q8K259 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gin1Q8K259 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gin1Q8K259 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gin1Q8K259 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gin1Q8K259 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gin1Q8K259 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gin1Q8K259 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gin1Q8K259 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gin1Q8K259 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gin1Q8K259 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gin1Q8K259 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gin1Q8K259 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gin1Q8K259 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gin1Q8K259 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gin1Q8K259 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gin1Q8K259 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gin1Q8K259 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gin1Q8K259 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gin1Q8K259 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gin1Q8K259 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gin1Q8K259 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gin1Q8K259 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gin1Q8K259 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gin1Q8K259 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gin1Q8K259 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gin1Q8K259 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gin1Q8K259 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gin1Q8K259 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gin1Q8K259 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gin1Q8K259 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gin1Q8K259 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gin1Q8K259 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gin1Q8K259 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gin1Q8K259 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gin1Q8K259 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gin1Q8K259 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gin1Q8K259 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.8 ms