Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nek9Q8K1R7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nek9Q8K1R7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nek9Q8K1R7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nek9Q8K1R7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nek9Q8K1R7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nek9Q8K1R7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nek9Q8K1R7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nek9Q8K1R7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nek9Q8K1R7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nek9Q8K1R7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Nek9Q8K1R7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nek9Q8K1R7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nek9Q8K1R7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nek9Q8K1R7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nek9Q8K1R7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nek9Q8K1R7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nek9Q8K1R7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Nek9Q8K1R7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nek9Q8K1R7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Nek9Q8K1R7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nek9Q8K1R7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nek9Q8K1R7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nek9Q8K1R7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nek9Q8K1R7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nek9Q8K1R7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nek9Q8K1R7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nek9Q8K1R7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nek9Q8K1R7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nek9Q8K1R7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nek9Q8K1R7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nek9Q8K1R7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nek9Q8K1R7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nek9Q8K1R7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Nek9Q8K1R7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nek9Q8K1R7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nek9Q8K1R7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nek9Q8K1R7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nek9Q8K1R7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nek9Q8K1R7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nek9Q8K1R7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nek9Q8K1R7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nek9Q8K1R7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nek9Q8K1R7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nek9Q8K1R7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nek9Q8K1R7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nek9Q8K1R7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nek9Q8K1R7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nek9Q8K1R7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nek9Q8K1R7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nek9Q8K1R7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nek9Q8K1R7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nek9Q8K1R7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nek9Q8K1R7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nek9Q8K1R7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nek9Q8K1R7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nek9Q8K1R7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nek9Q8K1R7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nek9Q8K1R7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nek9Q8K1R7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nek9Q8K1R7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nek9Q8K1R7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nek9Q8K1R7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nek9Q8K1R7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nek9Q8K1R7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nek9Q8K1R7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nek9Q8K1R7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nek9Q8K1R7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nek9Q8K1R7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nek9Q8K1R7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nek9Q8K1R7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nek9Q8K1R7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nek9Q8K1R7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nek9Q8K1R7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nek9Q8K1R7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nek9Q8K1R7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nek9Q8K1R7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nek9Q8K1R7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nek9Q8K1R7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nek9Q8K1R7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nek9Q8K1R7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nek9Q8K1R7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nek9Q8K1R7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nek9Q8K1R7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nek9Q8K1R7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nek9Q8K1R7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Nek9Q8K1R7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Nek9Q8K1R7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nek9Q8K1R7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nek9Q8K1R7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nek9Q8K1R7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nek9Q8K1R7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nek9Q8K1R7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nek9Q8K1R7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nek9Q8K1R7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nek9Q8K1R7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nek9Q8K1R7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nek9Q8K1R7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nek9Q8K1R7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nek9Q8K1R7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms