Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TwnkQ8CIW5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TwnkQ8CIW5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TwnkQ8CIW5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TwnkQ8CIW5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TwnkQ8CIW5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TwnkQ8CIW5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TwnkQ8CIW5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TwnkQ8CIW5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TwnkQ8CIW5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TwnkQ8CIW5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TwnkQ8CIW5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TwnkQ8CIW5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TwnkQ8CIW5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TwnkQ8CIW5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TwnkQ8CIW5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TwnkQ8CIW5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TwnkQ8CIW5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TwnkQ8CIW5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TwnkQ8CIW5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TwnkQ8CIW5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TwnkQ8CIW5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TwnkQ8CIW5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TwnkQ8CIW5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TwnkQ8CIW5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TwnkQ8CIW5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TwnkQ8CIW5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TwnkQ8CIW5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TwnkQ8CIW5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TwnkQ8CIW5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TwnkQ8CIW5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TwnkQ8CIW5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TwnkQ8CIW5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TwnkQ8CIW5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TwnkQ8CIW5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TwnkQ8CIW5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TwnkQ8CIW5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TwnkQ8CIW5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TwnkQ8CIW5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TwnkQ8CIW5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TwnkQ8CIW5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TwnkQ8CIW5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TwnkQ8CIW5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TwnkQ8CIW5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TwnkQ8CIW5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TwnkQ8CIW5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TwnkQ8CIW5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TwnkQ8CIW5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TwnkQ8CIW5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TwnkQ8CIW5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TwnkQ8CIW5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TwnkQ8CIW5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TwnkQ8CIW5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TwnkQ8CIW5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TwnkQ8CIW5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TwnkQ8CIW5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TwnkQ8CIW5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TwnkQ8CIW5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TwnkQ8CIW5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TwnkQ8CIW5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TwnkQ8CIW5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TwnkQ8CIW5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TwnkQ8CIW5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TwnkQ8CIW5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TwnkQ8CIW5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TwnkQ8CIW5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TwnkQ8CIW5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TwnkQ8CIW5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TwnkQ8CIW5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TwnkQ8CIW5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TwnkQ8CIW5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TwnkQ8CIW5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TwnkQ8CIW5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TwnkQ8CIW5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TwnkQ8CIW5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TwnkQ8CIW5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TwnkQ8CIW5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TwnkQ8CIW5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TwnkQ8CIW5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TwnkQ8CIW5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TwnkQ8CIW5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TwnkQ8CIW5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TwnkQ8CIW5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TwnkQ8CIW5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TwnkQ8CIW5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TwnkQ8CIW5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TwnkQ8CIW5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TwnkQ8CIW5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TwnkQ8CIW5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TwnkQ8CIW5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TwnkQ8CIW5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TwnkQ8CIW5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TwnkQ8CIW5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TwnkQ8CIW5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms