Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SbsnQ8CIT9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SbsnQ8CIT9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SbsnQ8CIT9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SbsnQ8CIT9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms