Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upp2Q8CGR7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upp2Q8CGR7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upp2Q8CGR7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upp2Q8CGR7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upp2Q8CGR7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upp2Q8CGR7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upp2Q8CGR7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upp2Q8CGR7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upp2Q8CGR7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upp2Q8CGR7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Upp2Q8CGR7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upp2Q8CGR7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upp2Q8CGR7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Upp2Q8CGR7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Upp2Q8CGR7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Upp2Q8CGR7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upp2Q8CGR7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upp2Q8CGR7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upp2Q8CGR7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upp2Q8CGR7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upp2Q8CGR7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upp2Q8CGR7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upp2Q8CGR7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upp2Q8CGR7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upp2Q8CGR7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upp2Q8CGR7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upp2Q8CGR7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upp2Q8CGR7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upp2Q8CGR7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upp2Q8CGR7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Upp2Q8CGR7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Upp2Q8CGR7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Upp2Q8CGR7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Upp2Q8CGR7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upp2Q8CGR7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upp2Q8CGR7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Upp2Q8CGR7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Upp2Q8CGR7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Upp2Q8CGR7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upp2Q8CGR7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Upp2Q8CGR7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Upp2Q8CGR7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upp2Q8CGR7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upp2Q8CGR7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upp2Q8CGR7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upp2Q8CGR7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upp2Q8CGR7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upp2Q8CGR7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upp2Q8CGR7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upp2Q8CGR7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upp2Q8CGR7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upp2Q8CGR7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upp2Q8CGR7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upp2Q8CGR7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upp2Q8CGR7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upp2Q8CGR7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upp2Q8CGR7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upp2Q8CGR7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Upp2Q8CGR7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Upp2Q8CGR7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Upp2Q8CGR7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upp2Q8CGR7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upp2Q8CGR7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Upp2Q8CGR7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upp2Q8CGR7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upp2Q8CGR7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upp2Q8CGR7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upp2Q8CGR7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upp2Q8CGR7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upp2Q8CGR7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upp2Q8CGR7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upp2Q8CGR7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upp2Q8CGR7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upp2Q8CGR7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Upp2Q8CGR7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upp2Q8CGR7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upp2Q8CGR7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Upp2Q8CGR7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upp2Q8CGR7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upp2Q8CGR7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upp2Q8CGR7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upp2Q8CGR7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upp2Q8CGR7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upp2Q8CGR7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upp2Q8CGR7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upp2Q8CGR7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Upp2Q8CGR7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Upp2Q8CGR7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upp2Q8CGR7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upp2Q8CGR7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upp2Q8CGR7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upp2Q8CGR7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upp2Q8CGR7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upp2Q8CGR7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upp2Q8CGR7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upp2Q8CGR7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upp2Q8CGR7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upp2Q8CGR7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upp2Q8CGR7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms