Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Snx8Q8CFD4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx8Q8CFD4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx8Q8CFD4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx8Q8CFD4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx8Q8CFD4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx8Q8CFD4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx8Q8CFD4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx8Q8CFD4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx8Q8CFD4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx8Q8CFD4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx8Q8CFD4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx8Q8CFD4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx8Q8CFD4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx8Q8CFD4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx8Q8CFD4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx8Q8CFD4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx8Q8CFD4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx8Q8CFD4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx8Q8CFD4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx8Q8CFD4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx8Q8CFD4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx8Q8CFD4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx8Q8CFD4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx8Q8CFD4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx8Q8CFD4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx8Q8CFD4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx8Q8CFD4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx8Q8CFD4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx8Q8CFD4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx8Q8CFD4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx8Q8CFD4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snx8Q8CFD4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx8Q8CFD4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx8Q8CFD4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx8Q8CFD4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx8Q8CFD4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx8Q8CFD4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx8Q8CFD4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx8Q8CFD4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx8Q8CFD4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx8Q8CFD4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx8Q8CFD4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx8Q8CFD4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx8Q8CFD4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx8Q8CFD4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx8Q8CFD4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx8Q8CFD4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx8Q8CFD4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx8Q8CFD4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx8Q8CFD4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx8Q8CFD4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx8Q8CFD4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx8Q8CFD4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx8Q8CFD4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx8Q8CFD4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx8Q8CFD4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx8Q8CFD4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx8Q8CFD4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx8Q8CFD4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx8Q8CFD4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx8Q8CFD4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx8Q8CFD4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx8Q8CFD4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx8Q8CFD4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx8Q8CFD4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx8Q8CFD4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx8Q8CFD4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx8Q8CFD4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx8Q8CFD4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx8Q8CFD4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx8Q8CFD4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx8Q8CFD4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx8Q8CFD4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx8Q8CFD4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx8Q8CFD4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx8Q8CFD4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx8Q8CFD4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx8Q8CFD4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx8Q8CFD4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx8Q8CFD4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx8Q8CFD4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx8Q8CFD4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx8Q8CFD4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx8Q8CFD4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx8Q8CFD4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snx8Q8CFD4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx8Q8CFD4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx8Q8CFD4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx8Q8CFD4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx8Q8CFD4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx8Q8CFD4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx8Q8CFD4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx8Q8CFD4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx8Q8CFD4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx8Q8CFD4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx8Q8CFD4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx8Q8CFD4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx8Q8CFD4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx8Q8CFD4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
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