Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF31

Uncharacterized protein C11orf94 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CF31 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8CF31 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CF31 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CF31 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CF31 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CF31 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CF31 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CF31 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CF31 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CF31 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8CF31 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8CF31 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8CF31 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8CF31 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8CF31 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8CF31 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8CF31 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8CF31 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CF31 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CF31 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8CF31 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8CF31 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8CF31 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8CF31 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8CF31 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8CF31 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CF31 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CF31 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CF31 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CF31 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CF31 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CF31 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CF31 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8CF31 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q8CF31 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8CF31 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8CF31 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8CF31 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8CF31 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8CF31 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8CF31 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8CF31 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8CF31 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8CF31 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8CF31 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8CF31 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8CF31 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8CF31 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8CF31 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8CF31 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8CF31 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8CF31 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8CF31 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8CF31 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8CF31 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8CF31 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8CF31 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8CF31 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8CF31 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8CF31 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8CF31 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8CF31 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8CF31 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8CF31 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8CF31 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8CF31 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8CF31 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CF31 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8CF31 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8CF31 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CF31 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CF31 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CF31 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CF31 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CF31 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CF31 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CF31 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CF31 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CF31 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CF31 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q8CF31 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q8CF31 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CF31 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CF31 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CF31 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CF31 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8CF31 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CF31 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CF31 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CF31 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CF31 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CF31 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CF31 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CF31 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CF31 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CF31 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CF31 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8CF31 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8CF31 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q8CF31 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms