Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp27Q8CEG8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp27Q8CEG8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp27Q8CEG8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp27Q8CEG8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp27Q8CEG8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp27Q8CEG8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp27Q8CEG8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp27Q8CEG8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp27Q8CEG8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp27Q8CEG8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp27Q8CEG8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp27Q8CEG8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp27Q8CEG8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp27Q8CEG8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp27Q8CEG8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp27Q8CEG8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp27Q8CEG8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp27Q8CEG8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp27Q8CEG8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp27Q8CEG8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp27Q8CEG8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp27Q8CEG8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp27Q8CEG8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp27Q8CEG8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp27Q8CEG8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp27Q8CEG8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp27Q8CEG8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp27Q8CEG8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp27Q8CEG8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp27Q8CEG8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp27Q8CEG8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp27Q8CEG8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp27Q8CEG8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp27Q8CEG8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp27Q8CEG8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp27Q8CEG8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp27Q8CEG8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp27Q8CEG8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp27Q8CEG8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp27Q8CEG8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp27Q8CEG8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp27Q8CEG8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp27Q8CEG8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp27Q8CEG8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp27Q8CEG8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp27Q8CEG8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp27Q8CEG8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp27Q8CEG8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp27Q8CEG8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp27Q8CEG8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp27Q8CEG8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp27Q8CEG8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp27Q8CEG8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp27Q8CEG8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp27Q8CEG8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp27Q8CEG8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp27Q8CEG8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp27Q8CEG8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp27Q8CEG8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp27Q8CEG8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp27Q8CEG8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp27Q8CEG8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp27Q8CEG8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp27Q8CEG8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp27Q8CEG8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp27Q8CEG8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp27Q8CEG8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp27Q8CEG8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp27Q8CEG8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp27Q8CEG8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp27Q8CEG8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp27Q8CEG8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp27Q8CEG8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp27Q8CEG8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp27Q8CEG8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp27Q8CEG8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp27Q8CEG8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp27Q8CEG8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp27Q8CEG8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp27Q8CEG8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp27Q8CEG8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp27Q8CEG8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp27Q8CEG8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp27Q8CEG8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp27Q8CEG8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp27Q8CEG8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp27Q8CEG8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp27Q8CEG8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp27Q8CEG8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp27Q8CEG8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp27Q8CEG8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp27Q8CEG8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp27Q8CEG8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp27Q8CEG8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp27Q8CEG8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp27Q8CEG8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp27Q8CEG8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp27Q8CEG8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp27Q8CEG8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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