Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDT5

4930415O20Rik, MCG18412, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930415O20RikQ8CDT5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930415O20RikQ8CDT5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930415O20RikQ8CDT5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930415O20RikQ8CDT5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930415O20RikQ8CDT5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930415O20RikQ8CDT5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930415O20RikQ8CDT5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4930415O20RikQ8CDT5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930415O20RikQ8CDT5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930415O20RikQ8CDT5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930415O20RikQ8CDT5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4930415O20RikQ8CDT5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930415O20RikQ8CDT5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930415O20RikQ8CDT5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930415O20RikQ8CDT5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930415O20RikQ8CDT5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930415O20RikQ8CDT5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930415O20RikQ8CDT5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930415O20RikQ8CDT5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930415O20RikQ8CDT5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930415O20RikQ8CDT5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930415O20RikQ8CDT5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930415O20RikQ8CDT5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930415O20RikQ8CDT5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930415O20RikQ8CDT5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930415O20RikQ8CDT5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930415O20RikQ8CDT5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930415O20RikQ8CDT5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930415O20RikQ8CDT5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930415O20RikQ8CDT5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930415O20RikQ8CDT5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930415O20RikQ8CDT5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930415O20RikQ8CDT5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930415O20RikQ8CDT5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930415O20RikQ8CDT5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930415O20RikQ8CDT5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.9 ms