Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrn3Q8CBC6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrn3Q8CBC6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrn3Q8CBC6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrn3Q8CBC6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrn3Q8CBC6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrn3Q8CBC6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrn3Q8CBC6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrn3Q8CBC6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrn3Q8CBC6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrn3Q8CBC6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrn3Q8CBC6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrn3Q8CBC6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrn3Q8CBC6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrn3Q8CBC6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrn3Q8CBC6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrn3Q8CBC6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrn3Q8CBC6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrn3Q8CBC6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrn3Q8CBC6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrn3Q8CBC6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrn3Q8CBC6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrn3Q8CBC6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrn3Q8CBC6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrn3Q8CBC6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrn3Q8CBC6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrn3Q8CBC6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrn3Q8CBC6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrn3Q8CBC6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrn3Q8CBC6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrn3Q8CBC6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrn3Q8CBC6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrn3Q8CBC6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrn3Q8CBC6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrn3Q8CBC6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrn3Q8CBC6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrn3Q8CBC6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrn3Q8CBC6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrn3Q8CBC6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrn3Q8CBC6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrn3Q8CBC6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrn3Q8CBC6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrn3Q8CBC6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrn3Q8CBC6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn3Q8CBC6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn3Q8CBC6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn3Q8CBC6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrn3Q8CBC6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrn3Q8CBC6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrn3Q8CBC6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrn3Q8CBC6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrn3Q8CBC6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrn3Q8CBC6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lrrn3Q8CBC6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn3Q8CBC6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn3Q8CBC6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn3Q8CBC6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn3Q8CBC6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn3Q8CBC6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn3Q8CBC6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn3Q8CBC6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn3Q8CBC6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrn3Q8CBC6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrn3Q8CBC6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrn3Q8CBC6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrn3Q8CBC6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrn3Q8CBC6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrn3Q8CBC6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrn3Q8CBC6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrn3Q8CBC6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrn3Q8CBC6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrn3Q8CBC6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrn3Q8CBC6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrn3Q8CBC6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrn3Q8CBC6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrn3Q8CBC6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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