Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB27

Yod1, Ubiquitin thioesterase OTU1, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yod1Q8CB27 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Yod1Q8CB27 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Yod1Q8CB27 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Yod1Q8CB27 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Yod1Q8CB27 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Yod1Q8CB27 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Yod1Q8CB27 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Yod1Q8CB27 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Yod1Q8CB27 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Yod1Q8CB27 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Yod1Q8CB27 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Yod1Q8CB27 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Yod1Q8CB27 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Yod1Q8CB27 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Yod1Q8CB27 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Yod1Q8CB27 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Yod1Q8CB27 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Yod1Q8CB27 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Yod1Q8CB27 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Yod1Q8CB27 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Yod1Q8CB27 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Yod1Q8CB27 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Yod1Q8CB27 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Yod1Q8CB27 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Yod1Q8CB27 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Yod1Q8CB27 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Yod1Q8CB27 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Yod1Q8CB27 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Yod1Q8CB27 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Yod1Q8CB27 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Yod1Q8CB27 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Yod1Q8CB27 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Yod1Q8CB27 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Yod1Q8CB27 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Yod1Q8CB27 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Yod1Q8CB27 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Yod1Q8CB27 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Yod1Q8CB27 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Yod1Q8CB27 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Yod1Q8CB27 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Yod1Q8CB27 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Yod1Q8CB27 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Yod1Q8CB27 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Yod1Q8CB27 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Yod1Q8CB27 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Yod1Q8CB27 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Yod1Q8CB27 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Yod1Q8CB27 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Yod1Q8CB27 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Yod1Q8CB27 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Yod1Q8CB27 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Yod1Q8CB27 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Yod1Q8CB27 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Yod1Q8CB27 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Yod1Q8CB27 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Yod1Q8CB27 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Yod1Q8CB27 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Yod1Q8CB27 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Yod1Q8CB27 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Yod1Q8CB27 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Yod1Q8CB27 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Yod1Q8CB27 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Yod1Q8CB27 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Yod1Q8CB27 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Yod1Q8CB27 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Yod1Q8CB27 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Yod1Q8CB27 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Yod1Q8CB27 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Yod1Q8CB27 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Yod1Q8CB27 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Yod1Q8CB27 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Yod1Q8CB27 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Yod1Q8CB27 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Yod1Q8CB27 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Yod1Q8CB27 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Yod1Q8CB27 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Yod1Q8CB27 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yod1Q8CB27 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yod1Q8CB27 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yod1Q8CB27 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yod1Q8CB27 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Yod1Q8CB27 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Yod1Q8CB27 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Yod1Q8CB27 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Yod1Q8CB27 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Yod1Q8CB27 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Yod1Q8CB27 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Yod1Q8CB27 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Yod1Q8CB27 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Yod1Q8CB27 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Yod1Q8CB27 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Yod1Q8CB27 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Yod1Q8CB27 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Yod1Q8CB27 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Yod1Q8CB27 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Yod1Q8CB27 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Yod1Q8CB27 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Yod1Q8CB27 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Yod1Q8CB27 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Yod1Q8CB27 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms