Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S4

Ccdc186, Coiled-coil domain-containing protein 186, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc186Q8C9S4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc186Q8C9S4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc186Q8C9S4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc186Q8C9S4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc186Q8C9S4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc186Q8C9S4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc186Q8C9S4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc186Q8C9S4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc186Q8C9S4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc186Q8C9S4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc186Q8C9S4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc186Q8C9S4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc186Q8C9S4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc186Q8C9S4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc186Q8C9S4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc186Q8C9S4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc186Q8C9S4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc186Q8C9S4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc186Q8C9S4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc186Q8C9S4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc186Q8C9S4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc186Q8C9S4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc186Q8C9S4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc186Q8C9S4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc186Q8C9S4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc186Q8C9S4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc186Q8C9S4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc186Q8C9S4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc186Q8C9S4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc186Q8C9S4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc186Q8C9S4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc186Q8C9S4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc186Q8C9S4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc186Q8C9S4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc186Q8C9S4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc186Q8C9S4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc186Q8C9S4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc186Q8C9S4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc186Q8C9S4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc186Q8C9S4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc186Q8C9S4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc186Q8C9S4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc186Q8C9S4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc186Q8C9S4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc186Q8C9S4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc186Q8C9S4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc186Q8C9S4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc186Q8C9S4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc186Q8C9S4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc186Q8C9S4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc186Q8C9S4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc186Q8C9S4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc186Q8C9S4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc186Q8C9S4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc186Q8C9S4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc186Q8C9S4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc186Q8C9S4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc186Q8C9S4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc186Q8C9S4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc186Q8C9S4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc186Q8C9S4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc186Q8C9S4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc186Q8C9S4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc186Q8C9S4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc186Q8C9S4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc186Q8C9S4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc186Q8C9S4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc186Q8C9S4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc186Q8C9S4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc186Q8C9S4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc186Q8C9S4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms