Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sall4Q8BX22 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sall4Q8BX22 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sall4Q8BX22 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sall4Q8BX22 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sall4Q8BX22 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sall4Q8BX22 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sall4Q8BX22 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sall4Q8BX22 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sall4Q8BX22 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall4Q8BX22 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall4Q8BX22 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall4Q8BX22 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sall4Q8BX22 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sall4Q8BX22 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall4Q8BX22 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall4Q8BX22 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall4Q8BX22 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sall4Q8BX22 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall4Q8BX22 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall4Q8BX22 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall4Q8BX22 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall4Q8BX22 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall4Q8BX22 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall4Q8BX22 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sall4Q8BX22 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sall4Q8BX22 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall4Q8BX22 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall4Q8BX22 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall4Q8BX22 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall4Q8BX22 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sall4Q8BX22 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall4Q8BX22 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall4Q8BX22 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall4Q8BX22 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall4Q8BX22 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall4Q8BX22 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall4Q8BX22 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sall4Q8BX22 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sall4Q8BX22 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sall4Q8BX22 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sall4Q8BX22 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sall4Q8BX22 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sall4Q8BX22 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sall4Q8BX22 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sall4Q8BX22 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sall4Q8BX22 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sall4Q8BX22 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sall4Q8BX22 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sall4Q8BX22 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sall4Q8BX22 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sall4Q8BX22 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall4Q8BX22 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall4Q8BX22 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sall4Q8BX22 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sall4Q8BX22 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sall4Q8BX22 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sall4Q8BX22 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sall4Q8BX22 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sall4Q8BX22 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sall4Q8BX22 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sall4Q8BX22 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sall4Q8BX22 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sall4Q8BX22 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sall4Q8BX22 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sall4Q8BX22 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sall4Q8BX22 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sall4Q8BX22 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall4Q8BX22 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall4Q8BX22 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall4Q8BX22 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall4Q8BX22 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall4Q8BX22 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall4Q8BX22 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sall4Q8BX22 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sall4Q8BX22 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sall4Q8BX22 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sall4Q8BX22 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sall4Q8BX22 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sall4Q8BX22 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sall4Q8BX22 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sall4Q8BX22 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sall4Q8BX22 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sall4Q8BX22 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sall4Q8BX22 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sall4Q8BX22 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sall4Q8BX22 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sall4Q8BX22 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sall4Q8BX22 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sall4Q8BX22 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sall4Q8BX22 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sall4Q8BX22 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sall4Q8BX22 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sall4Q8BX22 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sall4Q8BX22 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sall4Q8BX22 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sall4Q8BX22 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall4Q8BX22 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall4Q8BX22 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall4Q8BX22 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms