Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWW4

Larp4, La-related protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp4Q8BWW4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Larp4Q8BWW4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Larp4Q8BWW4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Larp4Q8BWW4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Larp4Q8BWW4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Larp4Q8BWW4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Larp4Q8BWW4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Larp4Q8BWW4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Larp4Q8BWW4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Larp4Q8BWW4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Larp4Q8BWW4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Larp4Q8BWW4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Larp4Q8BWW4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Larp4Q8BWW4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Larp4Q8BWW4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Larp4Q8BWW4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Larp4Q8BWW4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Larp4Q8BWW4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Larp4Q8BWW4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Larp4Q8BWW4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Larp4Q8BWW4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Larp4Q8BWW4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Larp4Q8BWW4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Larp4Q8BWW4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Larp4Q8BWW4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Larp4Q8BWW4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Larp4Q8BWW4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Larp4Q8BWW4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Larp4Q8BWW4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Larp4Q8BWW4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Larp4Q8BWW4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Larp4Q8BWW4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Larp4Q8BWW4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Larp4Q8BWW4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Larp4Q8BWW4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Larp4Q8BWW4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Larp4Q8BWW4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Larp4Q8BWW4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Larp4Q8BWW4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Larp4Q8BWW4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Larp4Q8BWW4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Larp4Q8BWW4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Larp4Q8BWW4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Larp4Q8BWW4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Larp4Q8BWW4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Larp4Q8BWW4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Larp4Q8BWW4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Larp4Q8BWW4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Larp4Q8BWW4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Larp4Q8BWW4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Larp4Q8BWW4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Larp4Q8BWW4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Larp4Q8BWW4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Larp4Q8BWW4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Larp4Q8BWW4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Larp4Q8BWW4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Larp4Q8BWW4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Larp4Q8BWW4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Larp4Q8BWW4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Larp4Q8BWW4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Larp4Q8BWW4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Larp4Q8BWW4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Larp4Q8BWW4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Larp4Q8BWW4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Larp4Q8BWW4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Larp4Q8BWW4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Larp4Q8BWW4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Larp4Q8BWW4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Larp4Q8BWW4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Larp4Q8BWW4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Larp4Q8BWW4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Larp4Q8BWW4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Larp4Q8BWW4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Larp4Q8BWW4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Larp4Q8BWW4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Larp4Q8BWW4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Larp4Q8BWW4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Larp4Q8BWW4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Larp4Q8BWW4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Larp4Q8BWW4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Larp4Q8BWW4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Larp4Q8BWW4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Larp4Q8BWW4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Larp4Q8BWW4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Larp4Q8BWW4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Larp4Q8BWW4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Larp4Q8BWW4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Larp4Q8BWW4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Larp4Q8BWW4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Larp4Q8BWW4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Larp4Q8BWW4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Larp4Q8BWW4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Larp4Q8BWW4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Larp4Q8BWW4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Larp4Q8BWW4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Larp4Q8BWW4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Larp4Q8BWW4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Larp4Q8BWW4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Larp4Q8BWW4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Larp4Q8BWW4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms