Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Snx17Q8BVL3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Snx17Q8BVL3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Snx17Q8BVL3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Snx17Q8BVL3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Snx17Q8BVL3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Snx17Q8BVL3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Snx17Q8BVL3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Snx17Q8BVL3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Snx17Q8BVL3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Snx17Q8BVL3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Snx17Q8BVL3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snx17Q8BVL3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snx17Q8BVL3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snx17Q8BVL3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snx17Q8BVL3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Snx17Q8BVL3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Snx17Q8BVL3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Snx17Q8BVL3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Snx17Q8BVL3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Snx17Q8BVL3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snx17Q8BVL3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Snx17Q8BVL3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snx17Q8BVL3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Snx17Q8BVL3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Snx17Q8BVL3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Snx17Q8BVL3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Snx17Q8BVL3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Snx17Q8BVL3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Snx17Q8BVL3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snx17Q8BVL3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snx17Q8BVL3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snx17Q8BVL3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Snx17Q8BVL3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snx17Q8BVL3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snx17Q8BVL3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snx17Q8BVL3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Snx17Q8BVL3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snx17Q8BVL3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snx17Q8BVL3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Snx17Q8BVL3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snx17Q8BVL3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snx17Q8BVL3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snx17Q8BVL3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snx17Q8BVL3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snx17Q8BVL3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Snx17Q8BVL3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Snx17Q8BVL3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snx17Q8BVL3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snx17Q8BVL3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snx17Q8BVL3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snx17Q8BVL3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snx17Q8BVL3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snx17Q8BVL3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snx17Q8BVL3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Snx17Q8BVL3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snx17Q8BVL3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snx17Q8BVL3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snx17Q8BVL3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snx17Q8BVL3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snx17Q8BVL3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Snx17Q8BVL3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snx17Q8BVL3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snx17Q8BVL3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snx17Q8BVL3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snx17Q8BVL3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snx17Q8BVL3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snx17Q8BVL3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snx17Q8BVL3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snx17Q8BVL3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snx17Q8BVL3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snx17Q8BVL3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Snx17Q8BVL3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snx17Q8BVL3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snx17Q8BVL3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snx17Q8BVL3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snx17Q8BVL3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snx17Q8BVL3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snx17Q8BVL3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snx17Q8BVL3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snx17Q8BVL3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx17Q8BVL3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx17Q8BVL3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx17Q8BVL3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Snx17Q8BVL3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snx17Q8BVL3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snx17Q8BVL3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snx17Q8BVL3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snx17Q8BVL3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snx17Q8BVL3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snx17Q8BVL3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snx17Q8BVL3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snx17Q8BVL3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Snx17Q8BVL3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snx17Q8BVL3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snx17Q8BVL3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snx17Q8BVL3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snx17Q8BVL3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snx17Q8BVL3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snx17Q8BVL3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
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