Protein–RNA interactions for Protein: Q8BS45

Ttc26, Intraflagellar transport protein 56, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc26Q8BS45 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttc26Q8BS45 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttc26Q8BS45 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttc26Q8BS45 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttc26Q8BS45 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ttc26Q8BS45 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc26Q8BS45 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc26Q8BS45 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc26Q8BS45 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc26Q8BS45 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc26Q8BS45 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc26Q8BS45 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc26Q8BS45 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc26Q8BS45 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc26Q8BS45 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc26Q8BS45 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc26Q8BS45 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc26Q8BS45 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc26Q8BS45 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc26Q8BS45 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc26Q8BS45 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttc26Q8BS45 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ttc26Q8BS45 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc26Q8BS45 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc26Q8BS45 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc26Q8BS45 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc26Q8BS45 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc26Q8BS45 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc26Q8BS45 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc26Q8BS45 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc26Q8BS45 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc26Q8BS45 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc26Q8BS45 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttc26Q8BS45 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttc26Q8BS45 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ttc26Q8BS45 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttc26Q8BS45 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttc26Q8BS45 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttc26Q8BS45 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttc26Q8BS45 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ttc26Q8BS45 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc26Q8BS45 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc26Q8BS45 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc26Q8BS45 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ttc26Q8BS45 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ttc26Q8BS45 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ttc26Q8BS45 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ttc26Q8BS45 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ttc26Q8BS45 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc26Q8BS45 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ttc26Q8BS45 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ttc26Q8BS45 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ttc26Q8BS45 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ttc26Q8BS45 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttc26Q8BS45 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc26Q8BS45 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc26Q8BS45 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ttc26Q8BS45 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ttc26Q8BS45 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ttc26Q8BS45 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ttc26Q8BS45 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ttc26Q8BS45 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ttc26Q8BS45 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ttc26Q8BS45 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ttc26Q8BS45 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ttc26Q8BS45 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ttc26Q8BS45 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ttc26Q8BS45 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ttc26Q8BS45 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ttc26Q8BS45 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttc26Q8BS45 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttc26Q8BS45 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttc26Q8BS45 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttc26Q8BS45 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttc26Q8BS45 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttc26Q8BS45 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc26Q8BS45 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc26Q8BS45 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc26Q8BS45 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttc26Q8BS45 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc26Q8BS45 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc26Q8BS45 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ttc26Q8BS45 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttc26Q8BS45 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttc26Q8BS45 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttc26Q8BS45 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttc26Q8BS45 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttc26Q8BS45 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttc26Q8BS45 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc26Q8BS45 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc26Q8BS45 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ttc26Q8BS45 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ttc26Q8BS45 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ttc26Q8BS45 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ttc26Q8BS45 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ttc26Q8BS45 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ttc26Q8BS45 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttc26Q8BS45 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttc26Q8BS45 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ttc26Q8BS45 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms