Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMP6

Acbd3, Golgi resident protein GCP60, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd3Q8BMP6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Acbd3Q8BMP6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Acbd3Q8BMP6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Acbd3Q8BMP6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acbd3Q8BMP6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acbd3Q8BMP6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acbd3Q8BMP6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Acbd3Q8BMP6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Acbd3Q8BMP6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Acbd3Q8BMP6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Acbd3Q8BMP6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Acbd3Q8BMP6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Acbd3Q8BMP6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Acbd3Q8BMP6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Acbd3Q8BMP6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Acbd3Q8BMP6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Acbd3Q8BMP6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Acbd3Q8BMP6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Acbd3Q8BMP6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Acbd3Q8BMP6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Acbd3Q8BMP6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Acbd3Q8BMP6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Acbd3Q8BMP6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Acbd3Q8BMP6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Acbd3Q8BMP6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Acbd3Q8BMP6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Acbd3Q8BMP6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Acbd3Q8BMP6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Acbd3Q8BMP6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Acbd3Q8BMP6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Acbd3Q8BMP6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Acbd3Q8BMP6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Acbd3Q8BMP6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Acbd3Q8BMP6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Acbd3Q8BMP6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Acbd3Q8BMP6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Acbd3Q8BMP6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Acbd3Q8BMP6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Acbd3Q8BMP6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Acbd3Q8BMP6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Acbd3Q8BMP6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Acbd3Q8BMP6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Acbd3Q8BMP6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Acbd3Q8BMP6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Acbd3Q8BMP6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Acbd3Q8BMP6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Acbd3Q8BMP6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Acbd3Q8BMP6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Acbd3Q8BMP6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Acbd3Q8BMP6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Acbd3Q8BMP6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Acbd3Q8BMP6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Acbd3Q8BMP6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Acbd3Q8BMP6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Acbd3Q8BMP6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Acbd3Q8BMP6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Acbd3Q8BMP6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Acbd3Q8BMP6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Acbd3Q8BMP6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Acbd3Q8BMP6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Acbd3Q8BMP6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Acbd3Q8BMP6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Acbd3Q8BMP6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Acbd3Q8BMP6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Acbd3Q8BMP6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Acbd3Q8BMP6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Acbd3Q8BMP6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Acbd3Q8BMP6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Acbd3Q8BMP6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Acbd3Q8BMP6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Acbd3Q8BMP6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Acbd3Q8BMP6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Acbd3Q8BMP6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Acbd3Q8BMP6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Acbd3Q8BMP6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Acbd3Q8BMP6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Acbd3Q8BMP6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Acbd3Q8BMP6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Acbd3Q8BMP6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Acbd3Q8BMP6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Acbd3Q8BMP6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Acbd3Q8BMP6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Acbd3Q8BMP6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Acbd3Q8BMP6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Acbd3Q8BMP6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Acbd3Q8BMP6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Acbd3Q8BMP6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Acbd3Q8BMP6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Acbd3Q8BMP6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Acbd3Q8BMP6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Acbd3Q8BMP6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Acbd3Q8BMP6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Acbd3Q8BMP6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Acbd3Q8BMP6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Acbd3Q8BMP6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Acbd3Q8BMP6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Acbd3Q8BMP6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Acbd3Q8BMP6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Acbd3Q8BMP6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Acbd3Q8BMP6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms