Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI4

Gen1, Flap endonuclease GEN homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gen1Q8BMI4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gen1Q8BMI4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gen1Q8BMI4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gen1Q8BMI4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gen1Q8BMI4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gen1Q8BMI4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gen1Q8BMI4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gen1Q8BMI4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gen1Q8BMI4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gen1Q8BMI4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gen1Q8BMI4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gen1Q8BMI4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gen1Q8BMI4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gen1Q8BMI4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gen1Q8BMI4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gen1Q8BMI4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gen1Q8BMI4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gen1Q8BMI4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gen1Q8BMI4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gen1Q8BMI4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gen1Q8BMI4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gen1Q8BMI4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gen1Q8BMI4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gen1Q8BMI4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gen1Q8BMI4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gen1Q8BMI4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gen1Q8BMI4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gen1Q8BMI4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gen1Q8BMI4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gen1Q8BMI4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gen1Q8BMI4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gen1Q8BMI4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gen1Q8BMI4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gen1Q8BMI4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gen1Q8BMI4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gen1Q8BMI4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gen1Q8BMI4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gen1Q8BMI4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gen1Q8BMI4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gen1Q8BMI4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gen1Q8BMI4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gen1Q8BMI4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gen1Q8BMI4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gen1Q8BMI4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gen1Q8BMI4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gen1Q8BMI4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gen1Q8BMI4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gen1Q8BMI4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gen1Q8BMI4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gen1Q8BMI4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gen1Q8BMI4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gen1Q8BMI4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gen1Q8BMI4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gen1Q8BMI4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gen1Q8BMI4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gen1Q8BMI4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gen1Q8BMI4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gen1Q8BMI4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gen1Q8BMI4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gen1Q8BMI4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gen1Q8BMI4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gen1Q8BMI4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gen1Q8BMI4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gen1Q8BMI4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gen1Q8BMI4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gen1Q8BMI4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gen1Q8BMI4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gen1Q8BMI4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gen1Q8BMI4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gen1Q8BMI4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gen1Q8BMI4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gen1Q8BMI4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gen1Q8BMI4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gen1Q8BMI4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gen1Q8BMI4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gen1Q8BMI4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gen1Q8BMI4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms