Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Usp54Q8BL06 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Usp54Q8BL06 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Usp54Q8BL06 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Usp54Q8BL06 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Usp54Q8BL06 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Usp54Q8BL06 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Usp54Q8BL06 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Usp54Q8BL06 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Usp54Q8BL06 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Usp54Q8BL06 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Usp54Q8BL06 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Usp54Q8BL06 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Usp54Q8BL06 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Usp54Q8BL06 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Usp54Q8BL06 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Usp54Q8BL06 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Usp54Q8BL06 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Usp54Q8BL06 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Usp54Q8BL06 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Usp54Q8BL06 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Usp54Q8BL06 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Usp54Q8BL06 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Usp54Q8BL06 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Usp54Q8BL06 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Usp54Q8BL06 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Usp54Q8BL06 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Usp54Q8BL06 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Usp54Q8BL06 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Usp54Q8BL06 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Usp54Q8BL06 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Usp54Q8BL06 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Usp54Q8BL06 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Usp54Q8BL06 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Usp54Q8BL06 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Usp54Q8BL06 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Usp54Q8BL06 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Usp54Q8BL06 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Usp54Q8BL06 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Usp54Q8BL06 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Usp54Q8BL06 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Usp54Q8BL06 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Usp54Q8BL06 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Usp54Q8BL06 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Usp54Q8BL06 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Usp54Q8BL06 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Usp54Q8BL06 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Usp54Q8BL06 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Usp54Q8BL06 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Usp54Q8BL06 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Usp54Q8BL06 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Usp54Q8BL06 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Usp54Q8BL06 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Usp54Q8BL06 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Usp54Q8BL06 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Usp54Q8BL06 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Usp54Q8BL06 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Usp54Q8BL06 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Usp54Q8BL06 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Usp54Q8BL06 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Usp54Q8BL06 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Usp54Q8BL06 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Usp54Q8BL06 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Usp54Q8BL06 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Usp54Q8BL06 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Usp54Q8BL06 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Usp54Q8BL06 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Usp54Q8BL06 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Usp54Q8BL06 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Usp54Q8BL06 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Usp54Q8BL06 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Usp54Q8BL06 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Usp54Q8BL06 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Usp54Q8BL06 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Usp54Q8BL06 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Usp54Q8BL06 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Usp54Q8BL06 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Usp54Q8BL06 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Usp54Q8BL06 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Usp54Q8BL06 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Usp54Q8BL06 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Usp54Q8BL06 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Usp54Q8BL06 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Usp54Q8BL06 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Usp54Q8BL06 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Usp54Q8BL06 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Usp54Q8BL06 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Usp54Q8BL06 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Usp54Q8BL06 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Usp54Q8BL06 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Usp54Q8BL06 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Usp54Q8BL06 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Usp54Q8BL06 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Usp54Q8BL06 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Usp54Q8BL06 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Usp54Q8BL06 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Usp54Q8BL06 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Usp54Q8BL06 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Usp54Q8BL06 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Usp54Q8BL06 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms