Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarcal1Q8BJL0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarcal1Q8BJL0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarcal1Q8BJL0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarcal1Q8BJL0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarcal1Q8BJL0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarcal1Q8BJL0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarcal1Q8BJL0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarcal1Q8BJL0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarcal1Q8BJL0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarcal1Q8BJL0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarcal1Q8BJL0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarcal1Q8BJL0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarcal1Q8BJL0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarcal1Q8BJL0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarcal1Q8BJL0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarcal1Q8BJL0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarcal1Q8BJL0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarcal1Q8BJL0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarcal1Q8BJL0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarcal1Q8BJL0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarcal1Q8BJL0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarcal1Q8BJL0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarcal1Q8BJL0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarcal1Q8BJL0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarcal1Q8BJL0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarcal1Q8BJL0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarcal1Q8BJL0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarcal1Q8BJL0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarcal1Q8BJL0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarcal1Q8BJL0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarcal1Q8BJL0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarcal1Q8BJL0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarcal1Q8BJL0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarcal1Q8BJL0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarcal1Q8BJL0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarcal1Q8BJL0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarcal1Q8BJL0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarcal1Q8BJL0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarcal1Q8BJL0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarcal1Q8BJL0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarcal1Q8BJL0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarcal1Q8BJL0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarcal1Q8BJL0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarcal1Q8BJL0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarcal1Q8BJL0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarcal1Q8BJL0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarcal1Q8BJL0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smarcal1Q8BJL0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarcal1Q8BJL0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarcal1Q8BJL0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarcal1Q8BJL0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarcal1Q8BJL0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarcal1Q8BJL0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarcal1Q8BJL0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarcal1Q8BJL0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarcal1Q8BJL0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarcal1Q8BJL0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarcal1Q8BJL0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Smarcal1Q8BJL0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarcal1Q8BJL0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarcal1Q8BJL0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarcal1Q8BJL0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarcal1Q8BJL0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarcal1Q8BJL0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarcal1Q8BJL0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarcal1Q8BJL0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarcal1Q8BJL0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarcal1Q8BJL0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarcal1Q8BJL0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarcal1Q8BJL0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarcal1Q8BJL0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarcal1Q8BJL0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarcal1Q8BJL0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Smarcal1Q8BJL0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarcal1Q8BJL0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Smarcal1Q8BJL0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarcal1Q8BJL0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarcal1Q8BJL0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarcal1Q8BJL0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarcal1Q8BJL0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarcal1Q8BJL0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarcal1Q8BJL0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarcal1Q8BJL0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarcal1Q8BJL0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Smarcal1Q8BJL0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarcal1Q8BJL0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarcal1Q8BJL0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarcal1Q8BJL0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarcal1Q8BJL0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarcal1Q8BJL0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarcal1Q8BJL0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarcal1Q8BJL0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarcal1Q8BJL0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarcal1Q8BJL0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarcal1Q8BJL0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarcal1Q8BJL0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarcal1Q8BJL0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms