Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prune1Q8BIW1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prune1Q8BIW1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prune1Q8BIW1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prune1Q8BIW1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Prune1Q8BIW1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prune1Q8BIW1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prune1Q8BIW1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prune1Q8BIW1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Prune1Q8BIW1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prune1Q8BIW1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prune1Q8BIW1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prune1Q8BIW1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prune1Q8BIW1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Prune1Q8BIW1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Prune1Q8BIW1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Prune1Q8BIW1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prune1Q8BIW1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prune1Q8BIW1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prune1Q8BIW1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Prune1Q8BIW1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prune1Q8BIW1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prune1Q8BIW1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prune1Q8BIW1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prune1Q8BIW1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prune1Q8BIW1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Prune1Q8BIW1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Prune1Q8BIW1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Prune1Q8BIW1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prune1Q8BIW1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prune1Q8BIW1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Prune1Q8BIW1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prune1Q8BIW1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prune1Q8BIW1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prune1Q8BIW1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prune1Q8BIW1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prune1Q8BIW1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prune1Q8BIW1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prune1Q8BIW1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Prune1Q8BIW1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prune1Q8BIW1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prune1Q8BIW1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prune1Q8BIW1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prune1Q8BIW1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prune1Q8BIW1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prune1Q8BIW1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prune1Q8BIW1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prune1Q8BIW1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prune1Q8BIW1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prune1Q8BIW1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prune1Q8BIW1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prune1Q8BIW1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prune1Q8BIW1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prune1Q8BIW1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prune1Q8BIW1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Prune1Q8BIW1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prune1Q8BIW1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prune1Q8BIW1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prune1Q8BIW1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Prune1Q8BIW1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Prune1Q8BIW1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prune1Q8BIW1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prune1Q8BIW1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prune1Q8BIW1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prune1Q8BIW1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prune1Q8BIW1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prune1Q8BIW1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prune1Q8BIW1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prune1Q8BIW1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prune1Q8BIW1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prune1Q8BIW1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prune1Q8BIW1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prune1Q8BIW1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prune1Q8BIW1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prune1Q8BIW1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prune1Q8BIW1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prune1Q8BIW1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prune1Q8BIW1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prune1Q8BIW1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prune1Q8BIW1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prune1Q8BIW1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prune1Q8BIW1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prune1Q8BIW1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prune1Q8BIW1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prune1Q8BIW1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prune1Q8BIW1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prune1Q8BIW1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prune1Q8BIW1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prune1Q8BIW1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prune1Q8BIW1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prune1Q8BIW1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prune1Q8BIW1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prune1Q8BIW1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prune1Q8BIW1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prune1Q8BIW1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prune1Q8BIW1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prune1Q8BIW1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prune1Q8BIW1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prune1Q8BIW1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prune1Q8BIW1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms