Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH48

Ubap1, Ubiquitin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1Q8BH48 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubap1Q8BH48 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubap1Q8BH48 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubap1Q8BH48 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubap1Q8BH48 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubap1Q8BH48 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubap1Q8BH48 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubap1Q8BH48 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ubap1Q8BH48 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ubap1Q8BH48 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubap1Q8BH48 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubap1Q8BH48 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubap1Q8BH48 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubap1Q8BH48 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubap1Q8BH48 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubap1Q8BH48 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubap1Q8BH48 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubap1Q8BH48 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubap1Q8BH48 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubap1Q8BH48 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubap1Q8BH48 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubap1Q8BH48 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubap1Q8BH48 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubap1Q8BH48 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubap1Q8BH48 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubap1Q8BH48 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubap1Q8BH48 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubap1Q8BH48 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubap1Q8BH48 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubap1Q8BH48 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubap1Q8BH48 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubap1Q8BH48 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubap1Q8BH48 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubap1Q8BH48 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubap1Q8BH48 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubap1Q8BH48 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubap1Q8BH48 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubap1Q8BH48 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubap1Q8BH48 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubap1Q8BH48 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubap1Q8BH48 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubap1Q8BH48 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubap1Q8BH48 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubap1Q8BH48 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubap1Q8BH48 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubap1Q8BH48 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubap1Q8BH48 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubap1Q8BH48 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubap1Q8BH48 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubap1Q8BH48 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubap1Q8BH48 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubap1Q8BH48 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubap1Q8BH48 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubap1Q8BH48 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubap1Q8BH48 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubap1Q8BH48 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubap1Q8BH48 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubap1Q8BH48 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubap1Q8BH48 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubap1Q8BH48 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubap1Q8BH48 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubap1Q8BH48 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubap1Q8BH48 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubap1Q8BH48 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubap1Q8BH48 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubap1Q8BH48 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubap1Q8BH48 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubap1Q8BH48 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubap1Q8BH48 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubap1Q8BH48 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubap1Q8BH48 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubap1Q8BH48 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubap1Q8BH48 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubap1Q8BH48 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubap1Q8BH48 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubap1Q8BH48 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubap1Q8BH48 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubap1Q8BH48 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubap1Q8BH48 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubap1Q8BH48 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubap1Q8BH48 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubap1Q8BH48 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubap1Q8BH48 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubap1Q8BH48 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubap1Q8BH48 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubap1Q8BH48 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubap1Q8BH48 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubap1Q8BH48 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubap1Q8BH48 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubap1Q8BH48 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ubap1Q8BH48 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubap1Q8BH48 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubap1Q8BH48 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubap1Q8BH48 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubap1Q8BH48 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubap1Q8BH48 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubap1Q8BH48 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubap1Q8BH48 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubap1Q8BH48 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubap1Q8BH48 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms