Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlhe23Q8BGW3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlhe23Q8BGW3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlhe23Q8BGW3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlhe23Q8BGW3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlhe23Q8BGW3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlhe23Q8BGW3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlhe23Q8BGW3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlhe23Q8BGW3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlhe23Q8BGW3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe23Q8BGW3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe23Q8BGW3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhe23Q8BGW3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhe23Q8BGW3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhe23Q8BGW3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhe23Q8BGW3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhe23Q8BGW3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhe23Q8BGW3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhe23Q8BGW3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhe23Q8BGW3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhe23Q8BGW3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhe23Q8BGW3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhe23Q8BGW3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhe23Q8BGW3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhe23Q8BGW3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhe23Q8BGW3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhe23Q8BGW3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhe23Q8BGW3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe23Q8BGW3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe23Q8BGW3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe23Q8BGW3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe23Q8BGW3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe23Q8BGW3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhe23Q8BGW3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhe23Q8BGW3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe23Q8BGW3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe23Q8BGW3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe23Q8BGW3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe23Q8BGW3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bhlhe23Q8BGW3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bhlhe23Q8BGW3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bhlhe23Q8BGW3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlhe23Q8BGW3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlhe23Q8BGW3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlhe23Q8BGW3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bhlhe23Q8BGW3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bhlhe23Q8BGW3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe23Q8BGW3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe23Q8BGW3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe23Q8BGW3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe23Q8BGW3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe23Q8BGW3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe23Q8BGW3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe23Q8BGW3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe23Q8BGW3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe23Q8BGW3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe23Q8BGW3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe23Q8BGW3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe23Q8BGW3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlhe23Q8BGW3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlhe23Q8BGW3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlhe23Q8BGW3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlhe23Q8BGW3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlhe23Q8BGW3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlhe23Q8BGW3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlhe23Q8BGW3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlhe23Q8BGW3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlhe23Q8BGW3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlhe23Q8BGW3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlhe23Q8BGW3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlhe23Q8BGW3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlhe23Q8BGW3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bhlhe23Q8BGW3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlhe23Q8BGW3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlhe23Q8BGW3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlhe23Q8BGW3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlhe23Q8BGW3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bhlhe23Q8BGW3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bhlhe23Q8BGW3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bhlhe23Q8BGW3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bhlhe23Q8BGW3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bhlhe23Q8BGW3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bhlhe23Q8BGW3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bhlhe23Q8BGW3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bhlhe23Q8BGW3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bhlhe23Q8BGW3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bhlhe23Q8BGW3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhe23Q8BGW3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bhlhe23Q8BGW3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe23Q8BGW3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe23Q8BGW3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe23Q8BGW3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms