Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim6Q8BGE7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim6Q8BGE7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim6Q8BGE7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim6Q8BGE7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim6Q8BGE7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trim6Q8BGE7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim6Q8BGE7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim6Q8BGE7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim6Q8BGE7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim6Q8BGE7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim6Q8BGE7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim6Q8BGE7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim6Q8BGE7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim6Q8BGE7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim6Q8BGE7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim6Q8BGE7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim6Q8BGE7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim6Q8BGE7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim6Q8BGE7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim6Q8BGE7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim6Q8BGE7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim6Q8BGE7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim6Q8BGE7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim6Q8BGE7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim6Q8BGE7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim6Q8BGE7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim6Q8BGE7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim6Q8BGE7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim6Q8BGE7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim6Q8BGE7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim6Q8BGE7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim6Q8BGE7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim6Q8BGE7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim6Q8BGE7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim6Q8BGE7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim6Q8BGE7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim6Q8BGE7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim6Q8BGE7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim6Q8BGE7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim6Q8BGE7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim6Q8BGE7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim6Q8BGE7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim6Q8BGE7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim6Q8BGE7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim6Q8BGE7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim6Q8BGE7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim6Q8BGE7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim6Q8BGE7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim6Q8BGE7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim6Q8BGE7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim6Q8BGE7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim6Q8BGE7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim6Q8BGE7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim6Q8BGE7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim6Q8BGE7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim6Q8BGE7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim6Q8BGE7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim6Q8BGE7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim6Q8BGE7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim6Q8BGE7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim6Q8BGE7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim6Q8BGE7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim6Q8BGE7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim6Q8BGE7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim6Q8BGE7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim6Q8BGE7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim6Q8BGE7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim6Q8BGE7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim6Q8BGE7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim6Q8BGE7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim6Q8BGE7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim6Q8BGE7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim6Q8BGE7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim6Q8BGE7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim6Q8BGE7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim6Q8BGE7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim6Q8BGE7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim6Q8BGE7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim6Q8BGE7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim6Q8BGE7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim6Q8BGE7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim6Q8BGE7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim6Q8BGE7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim6Q8BGE7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim6Q8BGE7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim6Q8BGE7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim6Q8BGE7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim6Q8BGE7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim6Q8BGE7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim6Q8BGE7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim6Q8BGE7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim6Q8BGE7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim6Q8BGE7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim6Q8BGE7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim6Q8BGE7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim6Q8BGE7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim6Q8BGE7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim6Q8BGE7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim6Q8BGE7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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