Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Katnb1Q8BG40 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Katnb1Q8BG40 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Katnb1Q8BG40 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Katnb1Q8BG40 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Katnb1Q8BG40 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Katnb1Q8BG40 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Katnb1Q8BG40 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Katnb1Q8BG40 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Katnb1Q8BG40 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Katnb1Q8BG40 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Katnb1Q8BG40 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Katnb1Q8BG40 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Katnb1Q8BG40 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Katnb1Q8BG40 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Katnb1Q8BG40 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Katnb1Q8BG40 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Katnb1Q8BG40 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Katnb1Q8BG40 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Katnb1Q8BG40 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Katnb1Q8BG40 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Katnb1Q8BG40 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Katnb1Q8BG40 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Katnb1Q8BG40 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Katnb1Q8BG40 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Katnb1Q8BG40 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Katnb1Q8BG40 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Katnb1Q8BG40 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Katnb1Q8BG40 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Katnb1Q8BG40 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Katnb1Q8BG40 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Katnb1Q8BG40 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Katnb1Q8BG40 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Katnb1Q8BG40 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Katnb1Q8BG40 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Katnb1Q8BG40 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Katnb1Q8BG40 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Katnb1Q8BG40 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Katnb1Q8BG40 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Katnb1Q8BG40 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Katnb1Q8BG40 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Katnb1Q8BG40 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Katnb1Q8BG40 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Katnb1Q8BG40 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Katnb1Q8BG40 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Katnb1Q8BG40 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Katnb1Q8BG40 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Katnb1Q8BG40 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Katnb1Q8BG40 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Katnb1Q8BG40 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Katnb1Q8BG40 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Katnb1Q8BG40 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Katnb1Q8BG40 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Katnb1Q8BG40 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Katnb1Q8BG40 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Katnb1Q8BG40 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Katnb1Q8BG40 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Katnb1Q8BG40 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Katnb1Q8BG40 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Katnb1Q8BG40 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Katnb1Q8BG40 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Katnb1Q8BG40 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Katnb1Q8BG40 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Katnb1Q8BG40 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Katnb1Q8BG40 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Katnb1Q8BG40 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Katnb1Q8BG40 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Katnb1Q8BG40 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Katnb1Q8BG40 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Katnb1Q8BG40 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Katnb1Q8BG40 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Katnb1Q8BG40 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Katnb1Q8BG40 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Katnb1Q8BG40 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms