Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ChfrQ810L3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ChfrQ810L3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ChfrQ810L3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChfrQ810L3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ChfrQ810L3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChfrQ810L3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChfrQ810L3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChfrQ810L3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChfrQ810L3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChfrQ810L3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ChfrQ810L3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ChfrQ810L3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ChfrQ810L3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ChfrQ810L3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChfrQ810L3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChfrQ810L3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChfrQ810L3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ChfrQ810L3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ChfrQ810L3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ChfrQ810L3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChfrQ810L3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChfrQ810L3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChfrQ810L3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChfrQ810L3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChfrQ810L3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ChfrQ810L3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ChfrQ810L3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChfrQ810L3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChfrQ810L3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChfrQ810L3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChfrQ810L3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChfrQ810L3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChfrQ810L3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ChfrQ810L3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ChfrQ810L3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ChfrQ810L3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ChfrQ810L3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ChfrQ810L3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChfrQ810L3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ChfrQ810L3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ChfrQ810L3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ChfrQ810L3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChfrQ810L3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ChfrQ810L3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ChfrQ810L3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ChfrQ810L3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ChfrQ810L3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ChfrQ810L3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ChfrQ810L3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ChfrQ810L3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChfrQ810L3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChfrQ810L3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChfrQ810L3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChfrQ810L3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChfrQ810L3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChfrQ810L3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChfrQ810L3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChfrQ810L3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChfrQ810L3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChfrQ810L3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChfrQ810L3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChfrQ810L3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ChfrQ810L3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChfrQ810L3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChfrQ810L3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChfrQ810L3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChfrQ810L3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChfrQ810L3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChfrQ810L3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChfrQ810L3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChfrQ810L3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChfrQ810L3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChfrQ810L3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChfrQ810L3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChfrQ810L3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChfrQ810L3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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