Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
TnnQ80Z71 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
TnnQ80Z71 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.67■■■■■ 4.26
TnnQ80Z71 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
TnnQ80Z71 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
TnnQ80Z71 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
TnnQ80Z71 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
TnnQ80Z71 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
TnnQ80Z71 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
TnnQ80Z71 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
TnnQ80Z71 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC41.6■■■■■ 4.25
TnnQ80Z71 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
TnnQ80Z71 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
TnnQ80Z71 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC41.59■■■■■ 4.25
TnnQ80Z71 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
TnnQ80Z71 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
TnnQ80Z71 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
TnnQ80Z71 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
TnnQ80Z71 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
TnnQ80Z71 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
TnnQ80Z71 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
TnnQ80Z71 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
TnnQ80Z71 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
TnnQ80Z71 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
TnnQ80Z71 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
TnnQ80Z71 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
TnnQ80Z71 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
TnnQ80Z71 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
TnnQ80Z71 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC41.39■■■■■ 4.22
TnnQ80Z71 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
TnnQ80Z71 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
TnnQ80Z71 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
TnnQ80Z71 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TnnQ80Z71 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TnnQ80Z71 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TnnQ80Z71 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TnnQ80Z71 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
TnnQ80Z71 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
TnnQ80Z71 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
TnnQ80Z71 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
TnnQ80Z71 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
TnnQ80Z71 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
TnnQ80Z71 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
TnnQ80Z71 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
TnnQ80Z71 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
TnnQ80Z71 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
TnnQ80Z71 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC41.24■■■■■ 4.19
TnnQ80Z71 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
TnnQ80Z71 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
TnnQ80Z71 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
TnnQ80Z71 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
TnnQ80Z71 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
TnnQ80Z71 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
TnnQ80Z71 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
TnnQ80Z71 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
TnnQ80Z71 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
TnnQ80Z71 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
TnnQ80Z71 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
TnnQ80Z71 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.18
TnnQ80Z71 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
TnnQ80Z71 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
TnnQ80Z71 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
TnnQ80Z71 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
TnnQ80Z71 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
TnnQ80Z71 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
TnnQ80Z71 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
TnnQ80Z71 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
TnnQ80Z71 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
TnnQ80Z71 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
TnnQ80Z71 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
TnnQ80Z71 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
TnnQ80Z71 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
TnnQ80Z71 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
TnnQ80Z71 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
TnnQ80Z71 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
TnnQ80Z71 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
TnnQ80Z71 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
TnnQ80Z71 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
TnnQ80Z71 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
TnnQ80Z71 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
TnnQ80Z71 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
TnnQ80Z71 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
TnnQ80Z71 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
TnnQ80Z71 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
TnnQ80Z71 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
TnnQ80Z71 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
TnnQ80Z71 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
TnnQ80Z71 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
TnnQ80Z71 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
TnnQ80Z71 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
TnnQ80Z71 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
TnnQ80Z71 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
TnnQ80Z71 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
TnnQ80Z71 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
TnnQ80Z71 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
TnnQ80Z71 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
TnnQ80Z71 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
TnnQ80Z71 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
TnnQ80Z71 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
TnnQ80Z71 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms