Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y56

Rbsn, Rabenosyn-5, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbsnQ80Y56 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
RbsnQ80Y56 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
RbsnQ80Y56 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
RbsnQ80Y56 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
RbsnQ80Y56 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
RbsnQ80Y56 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
RbsnQ80Y56 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,67
RbsnQ80Y56 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
RbsnQ80Y56 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
RbsnQ80Y56 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
RbsnQ80Y56 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
RbsnQ80Y56 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
RbsnQ80Y56 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
RbsnQ80Y56 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
RbsnQ80Y56 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
RbsnQ80Y56 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
RbsnQ80Y56 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
RbsnQ80Y56 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
RbsnQ80Y56 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
RbsnQ80Y56 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
RbsnQ80Y56 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
RbsnQ80Y56 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
RbsnQ80Y56 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,38■■□□□ 1,65
RbsnQ80Y56 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
RbsnQ80Y56 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
RbsnQ80Y56 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25,37■■□□□ 1,65
RbsnQ80Y56 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25,37■■□□□ 1,65
RbsnQ80Y56 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
RbsnQ80Y56 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
RbsnQ80Y56 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
RbsnQ80Y56 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
RbsnQ80Y56 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
RbsnQ80Y56 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
RbsnQ80Y56 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
RbsnQ80Y56 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
RbsnQ80Y56 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
RbsnQ80Y56 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
RbsnQ80Y56 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
RbsnQ80Y56 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
RbsnQ80Y56 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
RbsnQ80Y56 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
RbsnQ80Y56 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
RbsnQ80Y56 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
RbsnQ80Y56 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
RbsnQ80Y56 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
RbsnQ80Y56 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
RbsnQ80Y56 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
RbsnQ80Y56 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
RbsnQ80Y56 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
RbsnQ80Y56 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
RbsnQ80Y56 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
RbsnQ80Y56 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
RbsnQ80Y56 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
RbsnQ80Y56 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
RbsnQ80Y56 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
RbsnQ80Y56 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
RbsnQ80Y56 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
RbsnQ80Y56 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,28■■□□□ 1,64
RbsnQ80Y56 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
RbsnQ80Y56 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
RbsnQ80Y56 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
RbsnQ80Y56 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
RbsnQ80Y56 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,24■■□□□ 1,63
RbsnQ80Y56 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
RbsnQ80Y56 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
RbsnQ80Y56 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
RbsnQ80Y56 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
RbsnQ80Y56 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
RbsnQ80Y56 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
RbsnQ80Y56 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
RbsnQ80Y56 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
RbsnQ80Y56 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
RbsnQ80Y56 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
RbsnQ80Y56 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
RbsnQ80Y56 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
RbsnQ80Y56 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
RbsnQ80Y56 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
RbsnQ80Y56 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25,18■■□□□ 1,62
RbsnQ80Y56 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
RbsnQ80Y56 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25,18■■□□□ 1,62
RbsnQ80Y56 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
RbsnQ80Y56 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
RbsnQ80Y56 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
RbsnQ80Y56 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
RbsnQ80Y56 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
RbsnQ80Y56 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
RbsnQ80Y56 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
RbsnQ80Y56 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
RbsnQ80Y56 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
RbsnQ80Y56 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
RbsnQ80Y56 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,13■■□□□ 1,61
RbsnQ80Y56 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
RbsnQ80Y56 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
RbsnQ80Y56 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
RbsnQ80Y56 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
RbsnQ80Y56 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
RbsnQ80Y56 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
RbsnQ80Y56 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
RbsnQ80Y56 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
RbsnQ80Y56 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39,9 ms