Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg2bQ80XK6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg2bQ80XK6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atg2bQ80XK6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg2bQ80XK6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg2bQ80XK6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg2bQ80XK6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg2bQ80XK6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg2bQ80XK6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg2bQ80XK6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg2bQ80XK6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg2bQ80XK6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg2bQ80XK6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg2bQ80XK6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg2bQ80XK6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg2bQ80XK6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg2bQ80XK6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg2bQ80XK6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg2bQ80XK6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg2bQ80XK6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg2bQ80XK6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg2bQ80XK6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg2bQ80XK6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg2bQ80XK6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg2bQ80XK6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg2bQ80XK6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg2bQ80XK6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg2bQ80XK6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg2bQ80XK6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg2bQ80XK6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg2bQ80XK6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg2bQ80XK6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg2bQ80XK6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg2bQ80XK6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg2bQ80XK6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg2bQ80XK6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg2bQ80XK6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
Atg2bQ80XK6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg2bQ80XK6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg2bQ80XK6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg2bQ80XK6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg2bQ80XK6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg2bQ80XK6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg2bQ80XK6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg2bQ80XK6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg2bQ80XK6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg2bQ80XK6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg2bQ80XK6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg2bQ80XK6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg2bQ80XK6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg2bQ80XK6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg2bQ80XK6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg2bQ80XK6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg2bQ80XK6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg2bQ80XK6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg2bQ80XK6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg2bQ80XK6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg2bQ80XK6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg2bQ80XK6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg2bQ80XK6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg2bQ80XK6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg2bQ80XK6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg2bQ80XK6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg2bQ80XK6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atg2bQ80XK6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atg2bQ80XK6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atg2bQ80XK6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg2bQ80XK6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg2bQ80XK6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg2bQ80XK6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg2bQ80XK6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg2bQ80XK6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg2bQ80XK6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg2bQ80XK6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg2bQ80XK6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg2bQ80XK6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg2bQ80XK6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atg2bQ80XK6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atg2bQ80XK6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atg2bQ80XK6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg2bQ80XK6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg2bQ80XK6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg2bQ80XK6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg2bQ80XK6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg2bQ80XK6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg2bQ80XK6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg2bQ80XK6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg2bQ80XK6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg2bQ80XK6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg2bQ80XK6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg2bQ80XK6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg2bQ80XK6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg2bQ80XK6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg2bQ80XK6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg2bQ80XK6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg2bQ80XK6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg2bQ80XK6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg2bQ80XK6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg2bQ80XK6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg2bQ80XK6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms