Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD8

Prap1, Proline-rich acidic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prap1Q80XD8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prap1Q80XD8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prap1Q80XD8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prap1Q80XD8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prap1Q80XD8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prap1Q80XD8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prap1Q80XD8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prap1Q80XD8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prap1Q80XD8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prap1Q80XD8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prap1Q80XD8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prap1Q80XD8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prap1Q80XD8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prap1Q80XD8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prap1Q80XD8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prap1Q80XD8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prap1Q80XD8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prap1Q80XD8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prap1Q80XD8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prap1Q80XD8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prap1Q80XD8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prap1Q80XD8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prap1Q80XD8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prap1Q80XD8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prap1Q80XD8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prap1Q80XD8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prap1Q80XD8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prap1Q80XD8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prap1Q80XD8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prap1Q80XD8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prap1Q80XD8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prap1Q80XD8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prap1Q80XD8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prap1Q80XD8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prap1Q80XD8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prap1Q80XD8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prap1Q80XD8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prap1Q80XD8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prap1Q80XD8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prap1Q80XD8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prap1Q80XD8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prap1Q80XD8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prap1Q80XD8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prap1Q80XD8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prap1Q80XD8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prap1Q80XD8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prap1Q80XD8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prap1Q80XD8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prap1Q80XD8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prap1Q80XD8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prap1Q80XD8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prap1Q80XD8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prap1Q80XD8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prap1Q80XD8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prap1Q80XD8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prap1Q80XD8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prap1Q80XD8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prap1Q80XD8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prap1Q80XD8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prap1Q80XD8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prap1Q80XD8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prap1Q80XD8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prap1Q80XD8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prap1Q80XD8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prap1Q80XD8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prap1Q80XD8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prap1Q80XD8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prap1Q80XD8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prap1Q80XD8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prap1Q80XD8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Prap1Q80XD8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prap1Q80XD8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prap1Q80XD8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prap1Q80XD8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prap1Q80XD8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prap1Q80XD8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prap1Q80XD8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms