Protein–RNA interactions for Protein: Q80WM3

Cplx4, Complexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx4Q80WM3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cplx4Q80WM3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cplx4Q80WM3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cplx4Q80WM3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cplx4Q80WM3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cplx4Q80WM3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cplx4Q80WM3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cplx4Q80WM3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cplx4Q80WM3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cplx4Q80WM3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cplx4Q80WM3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cplx4Q80WM3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cplx4Q80WM3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cplx4Q80WM3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cplx4Q80WM3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cplx4Q80WM3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cplx4Q80WM3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cplx4Q80WM3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cplx4Q80WM3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cplx4Q80WM3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cplx4Q80WM3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cplx4Q80WM3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cplx4Q80WM3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cplx4Q80WM3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cplx4Q80WM3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cplx4Q80WM3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cplx4Q80WM3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cplx4Q80WM3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cplx4Q80WM3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cplx4Q80WM3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cplx4Q80WM3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cplx4Q80WM3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cplx4Q80WM3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cplx4Q80WM3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cplx4Q80WM3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cplx4Q80WM3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cplx4Q80WM3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cplx4Q80WM3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cplx4Q80WM3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cplx4Q80WM3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cplx4Q80WM3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cplx4Q80WM3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cplx4Q80WM3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cplx4Q80WM3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cplx4Q80WM3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cplx4Q80WM3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cplx4Q80WM3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cplx4Q80WM3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cplx4Q80WM3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cplx4Q80WM3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cplx4Q80WM3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cplx4Q80WM3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cplx4Q80WM3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cplx4Q80WM3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cplx4Q80WM3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cplx4Q80WM3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cplx4Q80WM3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cplx4Q80WM3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cplx4Q80WM3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cplx4Q80WM3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cplx4Q80WM3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cplx4Q80WM3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cplx4Q80WM3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cplx4Q80WM3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cplx4Q80WM3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cplx4Q80WM3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cplx4Q80WM3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cplx4Q80WM3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cplx4Q80WM3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cplx4Q80WM3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cplx4Q80WM3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cplx4Q80WM3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cplx4Q80WM3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cplx4Q80WM3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cplx4Q80WM3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cplx4Q80WM3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cplx4Q80WM3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cplx4Q80WM3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cplx4Q80WM3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cplx4Q80WM3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cplx4Q80WM3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cplx4Q80WM3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cplx4Q80WM3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cplx4Q80WM3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cplx4Q80WM3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cplx4Q80WM3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cplx4Q80WM3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cplx4Q80WM3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cplx4Q80WM3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cplx4Q80WM3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cplx4Q80WM3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cplx4Q80WM3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cplx4Q80WM3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cplx4Q80WM3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cplx4Q80WM3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cplx4Q80WM3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cplx4Q80WM3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cplx4Q80WM3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cplx4Q80WM3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cplx4Q80WM3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms