Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctdp1Q7TSG2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctdp1Q7TSG2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctdp1Q7TSG2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctdp1Q7TSG2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ctdp1Q7TSG2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ctdp1Q7TSG2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ctdp1Q7TSG2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctdp1Q7TSG2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctdp1Q7TSG2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctdp1Q7TSG2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctdp1Q7TSG2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctdp1Q7TSG2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctdp1Q7TSG2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctdp1Q7TSG2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctdp1Q7TSG2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctdp1Q7TSG2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctdp1Q7TSG2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctdp1Q7TSG2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctdp1Q7TSG2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctdp1Q7TSG2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctdp1Q7TSG2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctdp1Q7TSG2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctdp1Q7TSG2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctdp1Q7TSG2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ctdp1Q7TSG2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctdp1Q7TSG2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctdp1Q7TSG2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctdp1Q7TSG2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ctdp1Q7TSG2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ctdp1Q7TSG2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ctdp1Q7TSG2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctdp1Q7TSG2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctdp1Q7TSG2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ctdp1Q7TSG2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ctdp1Q7TSG2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ctdp1Q7TSG2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ctdp1Q7TSG2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ctdp1Q7TSG2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ctdp1Q7TSG2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ctdp1Q7TSG2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ctdp1Q7TSG2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ctdp1Q7TSG2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ctdp1Q7TSG2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ctdp1Q7TSG2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ctdp1Q7TSG2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctdp1Q7TSG2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctdp1Q7TSG2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctdp1Q7TSG2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ctdp1Q7TSG2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ctdp1Q7TSG2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctdp1Q7TSG2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctdp1Q7TSG2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctdp1Q7TSG2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ctdp1Q7TSG2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ctdp1Q7TSG2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctdp1Q7TSG2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctdp1Q7TSG2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctdp1Q7TSG2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctdp1Q7TSG2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctdp1Q7TSG2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctdp1Q7TSG2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctdp1Q7TSG2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctdp1Q7TSG2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctdp1Q7TSG2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctdp1Q7TSG2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctdp1Q7TSG2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctdp1Q7TSG2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctdp1Q7TSG2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctdp1Q7TSG2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ctdp1Q7TSG2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ctdp1Q7TSG2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ctdp1Q7TSG2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctdp1Q7TSG2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctdp1Q7TSG2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ctdp1Q7TSG2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctdp1Q7TSG2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctdp1Q7TSG2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctdp1Q7TSG2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctdp1Q7TSG2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ctdp1Q7TSG2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ctdp1Q7TSG2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ctdp1Q7TSG2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctdp1Q7TSG2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctdp1Q7TSG2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctdp1Q7TSG2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctdp1Q7TSG2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctdp1Q7TSG2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctdp1Q7TSG2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctdp1Q7TSG2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctdp1Q7TSG2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctdp1Q7TSG2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctdp1Q7TSG2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctdp1Q7TSG2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ctdp1Q7TSG2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ctdp1Q7TSG2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ctdp1Q7TSG2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctdp1Q7TSG2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms