Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ckap2lQ7TS74 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ckap2lQ7TS74 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ckap2lQ7TS74 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ckap2lQ7TS74 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ckap2lQ7TS74 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ckap2lQ7TS74 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ckap2lQ7TS74 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ckap2lQ7TS74 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ckap2lQ7TS74 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ckap2lQ7TS74 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ckap2lQ7TS74 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ckap2lQ7TS74 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ckap2lQ7TS74 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ckap2lQ7TS74 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ckap2lQ7TS74 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ckap2lQ7TS74 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ckap2lQ7TS74 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ckap2lQ7TS74 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ckap2lQ7TS74 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ckap2lQ7TS74 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ckap2lQ7TS74 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ckap2lQ7TS74 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ckap2lQ7TS74 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ckap2lQ7TS74 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ckap2lQ7TS74 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ckap2lQ7TS74 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ckap2lQ7TS74 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ckap2lQ7TS74 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ckap2lQ7TS74 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ckap2lQ7TS74 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ckap2lQ7TS74 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ckap2lQ7TS74 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ckap2lQ7TS74 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ckap2lQ7TS74 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ckap2lQ7TS74 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ckap2lQ7TS74 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ckap2lQ7TS74 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ckap2lQ7TS74 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ckap2lQ7TS74 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ckap2lQ7TS74 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ckap2lQ7TS74 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ckap2lQ7TS74 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ckap2lQ7TS74 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ckap2lQ7TS74 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ckap2lQ7TS74 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ckap2lQ7TS74 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ckap2lQ7TS74 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ckap2lQ7TS74 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ckap2lQ7TS74 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ckap2lQ7TS74 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ckap2lQ7TS74 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ckap2lQ7TS74 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ckap2lQ7TS74 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ckap2lQ7TS74 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ckap2lQ7TS74 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ckap2lQ7TS74 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ckap2lQ7TS74 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ckap2lQ7TS74 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ckap2lQ7TS74 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ckap2lQ7TS74 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ckap2lQ7TS74 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ckap2lQ7TS74 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ckap2lQ7TS74 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ckap2lQ7TS74 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ckap2lQ7TS74 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ckap2lQ7TS74 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ckap2lQ7TS74 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ckap2lQ7TS74 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ckap2lQ7TS74 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ckap2lQ7TS74 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ckap2lQ7TS74 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ckap2lQ7TS74 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ckap2lQ7TS74 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ckap2lQ7TS74 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ckap2lQ7TS74 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ckap2lQ7TS74 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms