Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd1l2Q7TN88 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd1l2Q7TN88 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd1l2Q7TN88 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd1l2Q7TN88 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd1l2Q7TN88 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd1l2Q7TN88 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd1l2Q7TN88 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd1l2Q7TN88 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd1l2Q7TN88 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd1l2Q7TN88 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd1l2Q7TN88 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd1l2Q7TN88 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd1l2Q7TN88 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pkd1l2Q7TN88 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pkd1l2Q7TN88 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd1l2Q7TN88 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd1l2Q7TN88 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd1l2Q7TN88 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd1l2Q7TN88 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd1l2Q7TN88 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd1l2Q7TN88 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd1l2Q7TN88 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd1l2Q7TN88 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd1l2Q7TN88 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd1l2Q7TN88 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd1l2Q7TN88 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd1l2Q7TN88 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd1l2Q7TN88 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd1l2Q7TN88 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd1l2Q7TN88 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd1l2Q7TN88 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd1l2Q7TN88 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd1l2Q7TN88 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd1l2Q7TN88 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd1l2Q7TN88 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd1l2Q7TN88 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd1l2Q7TN88 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd1l2Q7TN88 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd1l2Q7TN88 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd1l2Q7TN88 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd1l2Q7TN88 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd1l2Q7TN88 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd1l2Q7TN88 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd1l2Q7TN88 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd1l2Q7TN88 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd1l2Q7TN88 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd1l2Q7TN88 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd1l2Q7TN88 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd1l2Q7TN88 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd1l2Q7TN88 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd1l2Q7TN88 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd1l2Q7TN88 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd1l2Q7TN88 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd1l2Q7TN88 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd1l2Q7TN88 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd1l2Q7TN88 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd1l2Q7TN88 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd1l2Q7TN88 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd1l2Q7TN88 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd1l2Q7TN88 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd1l2Q7TN88 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd1l2Q7TN88 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkd1l2Q7TN88 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkd1l2Q7TN88 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkd1l2Q7TN88 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd1l2Q7TN88 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd1l2Q7TN88 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd1l2Q7TN88 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd1l2Q7TN88 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd1l2Q7TN88 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd1l2Q7TN88 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd1l2Q7TN88 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkd1l2Q7TN88 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkd1l2Q7TN88 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd1l2Q7TN88 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd1l2Q7TN88 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd1l2Q7TN88 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd1l2Q7TN88 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd1l2Q7TN88 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd1l2Q7TN88 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd1l2Q7TN88 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd1l2Q7TN88 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd1l2Q7TN88 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pkd1l2Q7TN88 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd1l2Q7TN88 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd1l2Q7TN88 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd1l2Q7TN88 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd1l2Q7TN88 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd1l2Q7TN88 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd1l2Q7TN88 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd1l2Q7TN88 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd1l2Q7TN88 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd1l2Q7TN88 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd1l2Q7TN88 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd1l2Q7TN88 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd1l2Q7TN88 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pkd1l2Q7TN88 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd1l2Q7TN88 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd1l2Q7TN88 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms