Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stambpl1Q76N33 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stambpl1Q76N33 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stambpl1Q76N33 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stambpl1Q76N33 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stambpl1Q76N33 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stambpl1Q76N33 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stambpl1Q76N33 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stambpl1Q76N33 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stambpl1Q76N33 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms