Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stambpl1Q76N33 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stambpl1Q76N33 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stambpl1Q76N33 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stambpl1Q76N33 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stambpl1Q76N33 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stambpl1Q76N33 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Stambpl1Q76N33 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stambpl1Q76N33 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stambpl1Q76N33 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stambpl1Q76N33 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stambpl1Q76N33 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stambpl1Q76N33 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stambpl1Q76N33 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stambpl1Q76N33 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stambpl1Q76N33 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms