Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tfap2eQ6VUP9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tfap2eQ6VUP9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tfap2eQ6VUP9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tfap2eQ6VUP9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tfap2eQ6VUP9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tfap2eQ6VUP9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tfap2eQ6VUP9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tfap2eQ6VUP9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tfap2eQ6VUP9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tfap2eQ6VUP9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tfap2eQ6VUP9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tfap2eQ6VUP9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tfap2eQ6VUP9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tfap2eQ6VUP9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tfap2eQ6VUP9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tfap2eQ6VUP9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tfap2eQ6VUP9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tfap2eQ6VUP9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tfap2eQ6VUP9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tfap2eQ6VUP9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tfap2eQ6VUP9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tfap2eQ6VUP9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tfap2eQ6VUP9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tfap2eQ6VUP9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tfap2eQ6VUP9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tfap2eQ6VUP9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tfap2eQ6VUP9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tfap2eQ6VUP9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tfap2eQ6VUP9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tfap2eQ6VUP9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tfap2eQ6VUP9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tfap2eQ6VUP9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tfap2eQ6VUP9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tfap2eQ6VUP9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfap2eQ6VUP9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfap2eQ6VUP9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfap2eQ6VUP9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfap2eQ6VUP9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfap2eQ6VUP9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfap2eQ6VUP9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfap2eQ6VUP9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2eQ6VUP9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2eQ6VUP9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2eQ6VUP9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2eQ6VUP9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfap2eQ6VUP9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tfap2eQ6VUP9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tfap2eQ6VUP9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfap2eQ6VUP9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms