Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc154Q6RUT8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc154Q6RUT8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc154Q6RUT8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc154Q6RUT8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc154Q6RUT8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc154Q6RUT8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc154Q6RUT8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc154Q6RUT8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc154Q6RUT8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc154Q6RUT8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc154Q6RUT8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc154Q6RUT8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc154Q6RUT8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc154Q6RUT8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc154Q6RUT8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc154Q6RUT8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc154Q6RUT8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc154Q6RUT8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc154Q6RUT8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc154Q6RUT8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc154Q6RUT8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc154Q6RUT8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc154Q6RUT8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc154Q6RUT8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc154Q6RUT8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc154Q6RUT8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc154Q6RUT8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc154Q6RUT8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc154Q6RUT8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc154Q6RUT8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc154Q6RUT8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc154Q6RUT8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc154Q6RUT8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc154Q6RUT8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc154Q6RUT8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc154Q6RUT8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc154Q6RUT8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc154Q6RUT8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc154Q6RUT8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc154Q6RUT8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc154Q6RUT8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc154Q6RUT8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc154Q6RUT8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc154Q6RUT8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc154Q6RUT8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc154Q6RUT8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc154Q6RUT8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc154Q6RUT8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc154Q6RUT8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc154Q6RUT8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc154Q6RUT8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc154Q6RUT8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc154Q6RUT8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc154Q6RUT8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc154Q6RUT8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc154Q6RUT8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc154Q6RUT8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc154Q6RUT8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc154Q6RUT8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc154Q6RUT8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc154Q6RUT8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc154Q6RUT8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc154Q6RUT8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc154Q6RUT8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc154Q6RUT8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc154Q6RUT8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc154Q6RUT8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc154Q6RUT8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc154Q6RUT8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc154Q6RUT8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc154Q6RUT8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc154Q6RUT8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc154Q6RUT8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc154Q6RUT8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc154Q6RUT8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc154Q6RUT8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc154Q6RUT8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc154Q6RUT8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc154Q6RUT8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc154Q6RUT8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc154Q6RUT8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc154Q6RUT8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc154Q6RUT8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc154Q6RUT8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc154Q6RUT8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc154Q6RUT8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc154Q6RUT8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc154Q6RUT8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc154Q6RUT8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc154Q6RUT8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc154Q6RUT8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc154Q6RUT8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc154Q6RUT8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc154Q6RUT8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc154Q6RUT8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc154Q6RUT8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc154Q6RUT8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc154Q6RUT8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms