Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc57Q6PHN1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc57Q6PHN1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc57Q6PHN1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc57Q6PHN1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc57Q6PHN1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc57Q6PHN1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc57Q6PHN1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc57Q6PHN1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc57Q6PHN1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc57Q6PHN1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc57Q6PHN1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc57Q6PHN1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc57Q6PHN1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc57Q6PHN1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc57Q6PHN1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc57Q6PHN1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc57Q6PHN1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc57Q6PHN1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc57Q6PHN1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc57Q6PHN1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc57Q6PHN1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc57Q6PHN1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc57Q6PHN1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc57Q6PHN1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc57Q6PHN1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc57Q6PHN1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc57Q6PHN1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc57Q6PHN1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc57Q6PHN1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc57Q6PHN1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc57Q6PHN1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc57Q6PHN1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc57Q6PHN1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc57Q6PHN1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc57Q6PHN1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc57Q6PHN1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc57Q6PHN1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc57Q6PHN1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc57Q6PHN1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc57Q6PHN1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc57Q6PHN1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc57Q6PHN1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc57Q6PHN1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc57Q6PHN1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc57Q6PHN1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc57Q6PHN1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc57Q6PHN1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc57Q6PHN1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc57Q6PHN1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc57Q6PHN1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc57Q6PHN1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc57Q6PHN1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc57Q6PHN1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc57Q6PHN1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc57Q6PHN1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc57Q6PHN1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc57Q6PHN1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc57Q6PHN1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc57Q6PHN1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc57Q6PHN1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc57Q6PHN1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc57Q6PHN1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc57Q6PHN1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc57Q6PHN1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc57Q6PHN1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc57Q6PHN1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc57Q6PHN1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc57Q6PHN1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc57Q6PHN1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc57Q6PHN1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc57Q6PHN1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc57Q6PHN1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc57Q6PHN1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc57Q6PHN1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc57Q6PHN1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc57Q6PHN1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc57Q6PHN1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc57Q6PHN1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc57Q6PHN1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc57Q6PHN1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc57Q6PHN1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc57Q6PHN1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc57Q6PHN1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc57Q6PHN1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc57Q6PHN1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc57Q6PHN1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc57Q6PHN1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc57Q6PHN1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc57Q6PHN1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc57Q6PHN1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc57Q6PHN1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc57Q6PHN1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc57Q6PHN1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc57Q6PHN1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc57Q6PHN1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc57Q6PHN1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc57Q6PHN1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms