Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF93

Pik3c3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c3Q6PF93 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3c3Q6PF93 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3c3Q6PF93 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3c3Q6PF93 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pik3c3Q6PF93 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c3Q6PF93 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c3Q6PF93 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c3Q6PF93 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c3Q6PF93 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3c3Q6PF93 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3c3Q6PF93 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3c3Q6PF93 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3c3Q6PF93 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3c3Q6PF93 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pik3c3Q6PF93 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pik3c3Q6PF93 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pik3c3Q6PF93 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pik3c3Q6PF93 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pik3c3Q6PF93 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pik3c3Q6PF93 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pik3c3Q6PF93 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pik3c3Q6PF93 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pik3c3Q6PF93 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pik3c3Q6PF93 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pik3c3Q6PF93 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pik3c3Q6PF93 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pik3c3Q6PF93 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pik3c3Q6PF93 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pik3c3Q6PF93 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pik3c3Q6PF93 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pik3c3Q6PF93 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pik3c3Q6PF93 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pik3c3Q6PF93 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pik3c3Q6PF93 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pik3c3Q6PF93 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pik3c3Q6PF93 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pik3c3Q6PF93 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pik3c3Q6PF93 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pik3c3Q6PF93 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pik3c3Q6PF93 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pik3c3Q6PF93 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pik3c3Q6PF93 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pik3c3Q6PF93 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pik3c3Q6PF93 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pik3c3Q6PF93 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pik3c3Q6PF93 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pik3c3Q6PF93 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pik3c3Q6PF93 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pik3c3Q6PF93 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pik3c3Q6PF93 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c3Q6PF93 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c3Q6PF93 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c3Q6PF93 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3c3Q6PF93 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3c3Q6PF93 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3c3Q6PF93 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3c3Q6PF93 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3c3Q6PF93 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3c3Q6PF93 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3c3Q6PF93 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3c3Q6PF93 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3c3Q6PF93 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3c3Q6PF93 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3c3Q6PF93 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pik3c3Q6PF93 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3c3Q6PF93 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3c3Q6PF93 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3c3Q6PF93 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3c3Q6PF93 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3c3Q6PF93 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3c3Q6PF93 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3c3Q6PF93 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3c3Q6PF93 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3c3Q6PF93 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3c3Q6PF93 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pik3c3Q6PF93 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pik3c3Q6PF93 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pik3c3Q6PF93 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pik3c3Q6PF93 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pik3c3Q6PF93 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pik3c3Q6PF93 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3c3Q6PF93 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3c3Q6PF93 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3c3Q6PF93 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3c3Q6PF93 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pik3c3Q6PF93 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3c3Q6PF93 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3c3Q6PF93 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3c3Q6PF93 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3c3Q6PF93 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3c3Q6PF93 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3c3Q6PF93 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3c3Q6PF93 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3c3Q6PF93 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c3Q6PF93 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c3Q6PF93 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c3Q6PF93 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c3Q6PF93 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c3Q6PF93 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3c3Q6PF93 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms