Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RgmaQ6PCX7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RgmaQ6PCX7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RgmaQ6PCX7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RgmaQ6PCX7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RgmaQ6PCX7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RgmaQ6PCX7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RgmaQ6PCX7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RgmaQ6PCX7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RgmaQ6PCX7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RgmaQ6PCX7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RgmaQ6PCX7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RgmaQ6PCX7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RgmaQ6PCX7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RgmaQ6PCX7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RgmaQ6PCX7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RgmaQ6PCX7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RgmaQ6PCX7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RgmaQ6PCX7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RgmaQ6PCX7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RgmaQ6PCX7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RgmaQ6PCX7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RgmaQ6PCX7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RgmaQ6PCX7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RgmaQ6PCX7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RgmaQ6PCX7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RgmaQ6PCX7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RgmaQ6PCX7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RgmaQ6PCX7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RgmaQ6PCX7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RgmaQ6PCX7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RgmaQ6PCX7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RgmaQ6PCX7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RgmaQ6PCX7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RgmaQ6PCX7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RgmaQ6PCX7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RgmaQ6PCX7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RgmaQ6PCX7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RgmaQ6PCX7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RgmaQ6PCX7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RgmaQ6PCX7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RgmaQ6PCX7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RgmaQ6PCX7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RgmaQ6PCX7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RgmaQ6PCX7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RgmaQ6PCX7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RgmaQ6PCX7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RgmaQ6PCX7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RgmaQ6PCX7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RgmaQ6PCX7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RgmaQ6PCX7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RgmaQ6PCX7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RgmaQ6PCX7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RgmaQ6PCX7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RgmaQ6PCX7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RgmaQ6PCX7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RgmaQ6PCX7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RgmaQ6PCX7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RgmaQ6PCX7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RgmaQ6PCX7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RgmaQ6PCX7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RgmaQ6PCX7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RgmaQ6PCX7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RgmaQ6PCX7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RgmaQ6PCX7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RgmaQ6PCX7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RgmaQ6PCX7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RgmaQ6PCX7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RgmaQ6PCX7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RgmaQ6PCX7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RgmaQ6PCX7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RgmaQ6PCX7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RgmaQ6PCX7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RgmaQ6PCX7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RgmaQ6PCX7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RgmaQ6PCX7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RgmaQ6PCX7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RgmaQ6PCX7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RgmaQ6PCX7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RgmaQ6PCX7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RgmaQ6PCX7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RgmaQ6PCX7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RgmaQ6PCX7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RgmaQ6PCX7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RgmaQ6PCX7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RgmaQ6PCX7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RgmaQ6PCX7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RgmaQ6PCX7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RgmaQ6PCX7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RgmaQ6PCX7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RgmaQ6PCX7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RgmaQ6PCX7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RgmaQ6PCX7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RgmaQ6PCX7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RgmaQ6PCX7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RgmaQ6PCX7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RgmaQ6PCX7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RgmaQ6PCX7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RgmaQ6PCX7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RgmaQ6PCX7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms