Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC061212Q6P8K3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC061212Q6P8K3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC061212Q6P8K3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BC061212Q6P8K3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC061212Q6P8K3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC061212Q6P8K3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC061212Q6P8K3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC061212Q6P8K3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BC061212Q6P8K3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BC061212Q6P8K3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BC061212Q6P8K3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC061212Q6P8K3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC061212Q6P8K3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BC061212Q6P8K3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BC061212Q6P8K3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC061212Q6P8K3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC061212Q6P8K3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC061212Q6P8K3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC061212Q6P8K3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC061212Q6P8K3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC061212Q6P8K3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC061212Q6P8K3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BC061212Q6P8K3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC061212Q6P8K3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC061212Q6P8K3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC061212Q6P8K3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC061212Q6P8K3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BC061212Q6P8K3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BC061212Q6P8K3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC061212Q6P8K3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC061212Q6P8K3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC061212Q6P8K3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC061212Q6P8K3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC061212Q6P8K3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC061212Q6P8K3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BC061212Q6P8K3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BC061212Q6P8K3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BC061212Q6P8K3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BC061212Q6P8K3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BC061212Q6P8K3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BC061212Q6P8K3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BC061212Q6P8K3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BC061212Q6P8K3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BC061212Q6P8K3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BC061212Q6P8K3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC061212Q6P8K3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC061212Q6P8K3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BC061212Q6P8K3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BC061212Q6P8K3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BC061212Q6P8K3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BC061212Q6P8K3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BC061212Q6P8K3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC061212Q6P8K3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC061212Q6P8K3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC061212Q6P8K3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC061212Q6P8K3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC061212Q6P8K3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC061212Q6P8K3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC061212Q6P8K3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC061212Q6P8K3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC061212Q6P8K3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC061212Q6P8K3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BC061212Q6P8K3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC061212Q6P8K3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC061212Q6P8K3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC061212Q6P8K3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC061212Q6P8K3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BC061212Q6P8K3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC061212Q6P8K3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC061212Q6P8K3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC061212Q6P8K3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC061212Q6P8K3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC061212Q6P8K3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC061212Q6P8K3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms