Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4P1

Serpina3a, Serine protease inhibitor A3A, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina3aQ6P4P1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Serpina3aQ6P4P1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Serpina3aQ6P4P1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Serpina3aQ6P4P1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Serpina3aQ6P4P1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Serpina3aQ6P4P1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Serpina3aQ6P4P1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Serpina3aQ6P4P1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Serpina3aQ6P4P1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Serpina3aQ6P4P1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Serpina3aQ6P4P1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Serpina3aQ6P4P1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Serpina3aQ6P4P1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Serpina3aQ6P4P1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Serpina3aQ6P4P1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Serpina3aQ6P4P1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Serpina3aQ6P4P1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Serpina3aQ6P4P1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Serpina3aQ6P4P1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Serpina3aQ6P4P1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Serpina3aQ6P4P1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Serpina3aQ6P4P1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Serpina3aQ6P4P1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Serpina3aQ6P4P1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Serpina3aQ6P4P1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Serpina3aQ6P4P1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Serpina3aQ6P4P1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Serpina3aQ6P4P1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Serpina3aQ6P4P1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Serpina3aQ6P4P1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Serpina3aQ6P4P1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Serpina3aQ6P4P1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Serpina3aQ6P4P1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Serpina3aQ6P4P1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Serpina3aQ6P4P1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Serpina3aQ6P4P1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Serpina3aQ6P4P1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Serpina3aQ6P4P1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Serpina3aQ6P4P1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Serpina3aQ6P4P1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Serpina3aQ6P4P1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Serpina3aQ6P4P1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Serpina3aQ6P4P1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Serpina3aQ6P4P1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Serpina3aQ6P4P1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Serpina3aQ6P4P1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Serpina3aQ6P4P1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Serpina3aQ6P4P1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Serpina3aQ6P4P1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Serpina3aQ6P4P1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Serpina3aQ6P4P1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Serpina3aQ6P4P1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Serpina3aQ6P4P1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Serpina3aQ6P4P1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Serpina3aQ6P4P1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Serpina3aQ6P4P1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Serpina3aQ6P4P1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Serpina3aQ6P4P1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Serpina3aQ6P4P1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Serpina3aQ6P4P1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpina3aQ6P4P1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpina3aQ6P4P1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpina3aQ6P4P1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Serpina3aQ6P4P1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Serpina3aQ6P4P1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Serpina3aQ6P4P1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Serpina3aQ6P4P1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Serpina3aQ6P4P1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Serpina3aQ6P4P1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Serpina3aQ6P4P1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Serpina3aQ6P4P1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Serpina3aQ6P4P1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Serpina3aQ6P4P1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Serpina3aQ6P4P1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Serpina3aQ6P4P1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Serpina3aQ6P4P1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Serpina3aQ6P4P1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Serpina3aQ6P4P1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Serpina3aQ6P4P1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Serpina3aQ6P4P1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpina3aQ6P4P1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpina3aQ6P4P1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpina3aQ6P4P1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpina3aQ6P4P1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Serpina3aQ6P4P1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Serpina3aQ6P4P1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Serpina3aQ6P4P1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Serpina3aQ6P4P1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Serpina3aQ6P4P1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Serpina3aQ6P4P1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Serpina3aQ6P4P1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Serpina3aQ6P4P1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Serpina3aQ6P4P1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Serpina3aQ6P4P1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Serpina3aQ6P4P1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Serpina3aQ6P4P1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Serpina3aQ6P4P1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Serpina3aQ6P4P1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Serpina3aQ6P4P1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Serpina3aQ6P4P1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms