Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L6

Nsd3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsd3Q6P2L6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nsd3Q6P2L6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nsd3Q6P2L6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nsd3Q6P2L6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nsd3Q6P2L6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nsd3Q6P2L6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nsd3Q6P2L6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nsd3Q6P2L6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nsd3Q6P2L6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Nsd3Q6P2L6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nsd3Q6P2L6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nsd3Q6P2L6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nsd3Q6P2L6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Nsd3Q6P2L6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Nsd3Q6P2L6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nsd3Q6P2L6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nsd3Q6P2L6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nsd3Q6P2L6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nsd3Q6P2L6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nsd3Q6P2L6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nsd3Q6P2L6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Nsd3Q6P2L6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Nsd3Q6P2L6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Nsd3Q6P2L6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Nsd3Q6P2L6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nsd3Q6P2L6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nsd3Q6P2L6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Nsd3Q6P2L6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nsd3Q6P2L6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nsd3Q6P2L6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nsd3Q6P2L6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nsd3Q6P2L6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nsd3Q6P2L6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nsd3Q6P2L6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nsd3Q6P2L6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nsd3Q6P2L6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nsd3Q6P2L6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nsd3Q6P2L6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Nsd3Q6P2L6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nsd3Q6P2L6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nsd3Q6P2L6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nsd3Q6P2L6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nsd3Q6P2L6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nsd3Q6P2L6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nsd3Q6P2L6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nsd3Q6P2L6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nsd3Q6P2L6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nsd3Q6P2L6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nsd3Q6P2L6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nsd3Q6P2L6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nsd3Q6P2L6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nsd3Q6P2L6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nsd3Q6P2L6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Nsd3Q6P2L6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Nsd3Q6P2L6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Nsd3Q6P2L6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nsd3Q6P2L6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Nsd3Q6P2L6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Nsd3Q6P2L6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Nsd3Q6P2L6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Nsd3Q6P2L6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nsd3Q6P2L6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nsd3Q6P2L6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nsd3Q6P2L6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nsd3Q6P2L6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nsd3Q6P2L6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nsd3Q6P2L6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Nsd3Q6P2L6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nsd3Q6P2L6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nsd3Q6P2L6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nsd3Q6P2L6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nsd3Q6P2L6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nsd3Q6P2L6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nsd3Q6P2L6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nsd3Q6P2L6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nsd3Q6P2L6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nsd3Q6P2L6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nsd3Q6P2L6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nsd3Q6P2L6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Nsd3Q6P2L6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Nsd3Q6P2L6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Nsd3Q6P2L6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Nsd3Q6P2L6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nsd3Q6P2L6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nsd3Q6P2L6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nsd3Q6P2L6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Nsd3Q6P2L6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nsd3Q6P2L6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nsd3Q6P2L6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nsd3Q6P2L6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Nsd3Q6P2L6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Nsd3Q6P2L6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Nsd3Q6P2L6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Nsd3Q6P2L6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Nsd3Q6P2L6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Nsd3Q6P2L6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Nsd3Q6P2L6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Nsd3Q6P2L6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Nsd3Q6P2L6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Nsd3Q6P2L6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms